辦食品加工廠流程、證件、時間如下：
因為辦理食品加工廠，需要先成立公司（不能是個體戶），故首先需要到工商部門進行公司名稱預先核準，再到質監部門辦理組織機構代碼證賦碼，再到質監局辦理生產許可證，即QS證，再辦理營業執照、組織機構代碼證，再到工商部門辦理許可證，這樣，才有加工的資質。這些證件辦下來大約6個月時間，10000元左右。除此之外還要辦生產許可證，涉及到生產廠房、更衣室、洗消間、化驗室、倉庫、檢驗設備、生產設備、檢驗員，這些土建工程及生產、檢驗設備費用。
辦食品加工廠詳細流程如下：
取得廠房所在房地產的產權或使用權；
確保該房地產可以用於工業用途；
取得《營業執照》與開戶許可（礦泉水企業應開始辦理探/采礦許可與取水許可）；
完成廠房設計與施工圖紙，及設備選型；
按改擴建項目辦理環保、消防、安全等“三同時”；
辦理取水許可、排汙許可、戶外廣告許可、商品條碼等（投產前先委托加工的則需辦理食品經營許可）；
廠房驗收與設備安裝調試，同步辦理計量檢定、特種設備、易制毒/易制爆備案、安全生產許可等（有易拉罐的還要辦理輻射許可）；
建立食品安全管理體系，辦理食品生產許可，同時生產包裝的需前置辦理食品相關產品生產許可；
出口企業辦理出口食品生產企業備案；
有余力的再辦理體系認證等。