使用食用檸檬酸、食品級鹽酸(硫酸)等酸性物質也是不錯的選擇，不僅除垢效果好，而且成本較低。首先將檸檬酸溶解在水杯中，取下飲水機的水桶，左右扭動，取下智能座，倒入檸檬酸溶液。無制冷的飲水機從熱水口接水倒入上口，反復倒幾次，混合均勻。如果是帶制冷的飲水機，也要從冷水口取水倒入上口，攪拌均勻。
家裏有食醋，醋也可以去垢。將少許醋直接倒入泡沫中，最後用水沖洗幹凈。水垢沈積過多時，可以在清洗前將桶內的水倒掉，將桶晾幹或靜置幾天使水垢失水，這樣就容易剝落。加入洗潔精，稍微浸泡壹下，然後搖勻，就比較容易洗掉了。
加入沙子或竹炭，放些水，最好是壹些鹽，然後搖晃瓶子就幹凈了。
除了清洗礦泉水桶，首先要保證自己飲用水的質量。壹般飲水機使用60天左右就要徹底消毒清洗，最好由供水單位的專業消毒人員操作，這樣才能保證消毒質量。盡量選擇新桶和透明無色的桶裝水。舊桶用久了，內壁會不光滑，尤其是存放礦泉水的桶，內壁容易出現礦物質沈澱，不容易清洗幹凈，還會滋生細菌。