小智原來的搭檔是皮卡丘，是達木博士給他的。在長盤森林之旅中，小智分別征服了綠毛毛蟲和比比鳥。綠色的毛毛蟲最終在後來的冒險中進化成了蝴蝶，卻帶著另壹只粉色的蝴蝶飛走了。在遊輪上，小智短暫地把蝴蝶換成了壹只LADA，然後又換了回來。比比鳥進化成了雕塑，被小智放歸野外，只留下壹句話:完事我回來接妳。
在接下來的冒險中，小智先後征服了前三大皇族，妙蛙種子、小火龍和傑尼龜。小火龍進化成了壹條噴火的龍，傑尼龜被安排到了消防隊。大鉗蟹在鄭輝所在的燈塔被制服，並被送回達木博士研究所，該研究所後來演變成壹只巨大的螯蟹。在野外，他拿走了搶他帽子的熱猴，後來送給了壹個道長。他在黑雲城電廠小治裏拿了占電廠的臭臭泥，在野元野區拿了30個肯泰羅，全部送到了達木博士研究所。
回到鎮心鎮，遇到壹個吸盤娃娃，壹直住在小智家。根據官網的資料，我被小智說服了。肖誌在攻打金路亭時和壹個鬼斯通人成了朋友，後來把它送給了主人納粹。在峽谷裏得到了壹個蛋，這個蛋的所有權屬於肖智，但是孵化出來的鮑比把小霞當成了主人，所以他把它給了小霞。
在奧蘭治聯盟的冒險中，肖誌先後征服了乘龍和卡比獸，乘龍在奧蘭治群島之行後被釋放，但他後來只見過他壹次。
然後在成都，小智在壹片枯萎的森林裏征服了赫拉克洛斯，然後他遇到了壹片倔強的菊花葉。小智用感情制服了它，後來它演變成了月桂葉。然後他制服了火球鼠和小鋸鱷，火球鼠後來進化成了火巖鼠。
我在森林裏征服了壹個不同顏色的貓頭夜鷹。小智幫助繁殖屋奪回了被火箭搶走的蛋，得到了壹個蛋作為感謝。後來，它孵出了壹只小象，後來進化成了頓甲。Yukira從她從空木博士得到的蛋中孵化出來，但是小智沒有照顧她。她在捕蟲會上抓到壹只大針蜂，後來把它給了她的朋友奈奈。
在方圓壹帶，小智征服了橘林中的傲骨燕，後來進化成了大王燕，最後成為了木守宮森林中的蜥蜴王。他征服了五鬥島附近的龍蝦兵，鋼鐵之谷被野生神奇寶貝襲擊的煤鬼，某島雪域的雪童，大型慶典時進化成冰鬼護衛。他在戰爭發展區征服了搶他帽子的長尾怪手，在深澳地區進化成了雙尾怪。後來，他與小光的叉尾浮鼬交換。
到達深澳地區後不久，肖智馴服了壹只姆克兒，並最終進化成了壹只慕克鷹。然後在第五集馴服了草苗龜，最後進化成了土臺龜，從對手保羅手中接過了他不要的小火焰猴，最後進化成了火焰猴。他在為草苗龜做特殊訓練時馴服了壹只天蠍，然後通過他鋒利的牙齒進化成了天蠍王。在後來的劇情中，小智馴服了壹只想要學習流星群的地鯊，這是他的第壹個準神。
在何忠地區，肖誌還收集了三只水獺、暖豬和藤蛇。暖豬進化成了炸豬，當然也收集了當地的看門人，布谷鳥鴿子，最終進化成了驕傲的野雞。在溫泉酒店遇到壹只黑眼鱷魚，吃了之後就進化成了流浪鱷。老師送的神奇寶貝蛋孵化成了滑溜溜的小男孩，在亞切森林裏被帶走，最終進化成了保姆蟲。小智在水中尋找草藥時遭到了藍蟾蜍的襲擊，但他沒想到小智會安撫他。在去萊文城的路上，小智制服了壹只石丸子，並進化成了地幔巖。
在卡洛斯地區，小智馴服了呱呱叫的青蛙，最終成為了可以羈絆進化的甲賀忍蛙，成為了小智最強的神奇寶貝之壹，後來被釋放出來幫助解決危機。途中，他馴服了這裏家喻戶曉的小箭雀，最終進化成了壹只兇猛的箭鷹。在森林裏，肖智馴服了被譽為森林拳擊冠軍的摔跤鷹人。在去海逸城的路上，小智馴服了壹個粘在他臉上的寶物，後來進化成了黏美龍，是他的第二個準神，後來被放回了濕地。旅途中，摔跤鷹人撿到壹個蛋，孵化出壹只嗡嗡叫的蝙蝠，被肖智制服，後來進化成音波龍。
在旅程尚未結束的阿羅拉，小智獲得了Lotom繪本，安撫了野生的火斑喵，獲得了醫生給他的巖犬。後來在黃昏中進化成鬃巖狼人，用食物安撫壹只饑餓的木木貓頭鷹，壹直睡覺。後來他在夢中受到了神獸的照顧，壹只名叫小星雲的科斯古墨後來進化成了索爾加雷奧。