商標註冊申請的“實質審查”是指國家商標局根據《商標法》和《商標法實施條例》的規定，通過檢索、分析、比較和必要的調查研究，對符合條件的商標註冊申請按照申請日期的先後順序進行商標註冊合法性審查，以決定是否給予初步審查或者駁回的行為。實質審查是申請商標時決定是否取得商標專用權的關鍵環節。
實質審查的內容有哪些？
商標實質審查的內容通常可以分為兩部分:
即商標的絕對條件和相對條件的審查。
絕對條件
絕對條件審查又稱申請註冊商標的條件審查，包括對申請註冊商標的絕對合法性和顯著性的審查；
相對條件
對商標申請註冊的相對條件的審查，也稱為對商標是否與在先權利相沖突的審查。
實質性審查的內容主要包括以下三個方面:
(1)申請註冊的商標的文字、圖形、字母、數字、立體標誌、顏色組合等構成要素是否違反《商標法》的禁止性條款，即《商標法》第十條、第十壹條的規定；
(2)申請註冊的商標是否符合法定要求，即商標使用的文字、圖形、字母、數字、立體標誌和顏色組合是否顯著；
(3)申請註冊的商標是否與他人在先申請和註冊的商標權相沖突。
上述對(1)項中禁止條款的審查和對(2)項是否顯著的審查，是對商標合法性的審查，即對商標註冊申請是否違反《商標法》禁止性規定的審查，也稱為禁止商標註冊的“絕對理由”的審查。
如果申請註冊的商標違反商標法律法規的禁止性條款，且不具有顯著性，將被駁回商標註冊的實質審查階段。對上述第(三)項是否與他人在先權利相沖突的審查，也稱為禁止商標註冊的“相對理由”的審查。即如果申請註冊的商標與他人先前申請註冊的商標權相沖突，也將在實質審查階段被駁回。