孫慶山不滿商會的決策，與管家朱食糠密謀,決計鋌而走險，采取移花接木，以次充好，彌補因災遭受的損失。李聚興離開懷慶去天津穩定大局,懷幫內私下猜測議論紛紛。李聚興輾轉到北京，得知同仁堂懷藥告急，克服千難萬險，解同仁堂之急，樹懷慶人風範。孫慶山的傻兒子娶親的新婚之夜，新娘李菡芝自盡，李、孫兩家從此接下冤仇。壹波未平，壹波又起。劉滿囤因不滿孫慶山克扣打井的銀子,致使打的井半途而廢，造成很大的損失，帶領藥農到孫府討說法，被官府緝拿，掀起軒然大波。孫慶山暗度陳倉，在“跑水”途中采取偷梁換柱之術陷害協盛全，使其蒙受不白之冤，引起懷幫內部混亂。商會為避免殊死競爭，采取亡羊補牢，統壹懷藥商標。孫慶山原承諾李安奇事情辦妥後升任他為泰興二掌櫃，結果孫慶山食言，以避風頭為借口打發他回家，使得李安奇心懷不滿。事情敗露後，朱食糠求自保將李安奇騙進神農山，最終他也攜款出逃。雞飛蛋打的孫慶山面臨商行的破產和官府的追究，又生出許多是非。 八國聯軍攻占大沽炮臺，占領天津，進而打向北京。李沁懷送藥材到達天津，壹心為國，慷慨解囊，暗中資助義和團抗擊外國列強。山奇秀郎利用孫海泉采取豪取強奪，使得懷商損失慘重。山奇秀郎依仗軍隊的支持得寸進尺，又到北京懷商會館發難。膽大妄為的山奇秀郎，來到懷慶府遭到商會夥計圍攻。
協盛全在給同仁堂送藥材的途中，途徑定興遭受劫匪攔路搶劫，李沁懷也受到劫匪的綁架。懷慶府知府高峻峰秉公斷案，將孫海泉與史長海逮捕入獄。史長海突然暴死監牢，使得案情撲朔迷離，險象環生，李、孫兩家的仇恨愈結愈深。李聚興為改良懷藥種植辦法，提高懷藥品質，引起商會內部矛盾。高峻峰遭陷害被罷官，宋余風利用裙帶關系當上知府。孫海泉出獄後，與宋余風串通壹氣，設計陷害李沁懷。李聚興洞察宋余風與孫海泉的陰謀，提出主動投案，受到家人極力反對。李沁懷被關進大牢，在宋余風探監時，李沁懷卻突然暴死牢房。壹個多月後，孫海泉在得月樓聽到壹個驚人的消息，有人在漢口見過李沁懷的身影，不僅打亂了他的平靜，也打亂了李家的平靜。宋余風派人欲掘墓驗棺，又演繹出許多始料不及的事情。
懷慶藥商的誠信,李聚興博大的襟懷,李沁懷愛國的敬業精神,孫慶山膨脹的私欲,孫海泉復仇的烈火,宋余風的欺上瞞下,演繹出許許多多意料之外、人性化了的故事。大清王朝在革命的風雨中搖搖欲墜，尤其是辛亥革命標誌著壹個新的變革時代的開始，懷商面對新的考驗，在這劃時代的變革中發揚中華民族的愛國精神。
世代恩仇，壹部懷藥發家史，將妳帶入那壹幕幕不堪回首的歲月。