於2000年3月通過ISO9001國際質量體系認證； 2004年7月份，公司成為國家質檢總局首批通過市場準入，獲得 “QS”標誌的乳品企業；同年，公司產品被指定為“人民大會堂”宴會專用牛奶。2005年10月，公司再次被國家質量監督檢驗檢疫總局授予“中國名牌產品”稱號。2007年1月，公司順利通過了ISO9000、ISO14000、ISO22000、OHSAS18000四大管理體系的審核，成為最早通過四合壹管理體系整合的食品企業。2009年，公司獲得“中國馳名商標”稱號，成為國內唯壹壹家同時擁有“中國名牌產品”、“中國馳名商標”兩項稱號的乳品企業。
幾十年來，三元食品做為歷屆“人大”、“政協”兩會等中央及北京市重大政治活動、經濟文化大型活動的乳品特供商；2007年開始，公司承擔的中南海特需產品的供應工作，2008年，北京奧運會和殘奧會期間，公司承擔並順利完成對麥當勞奧運村店運動員用特供乳制品以及四十余家註冊媒體飯店、部分貴賓飯店、運動員入住奧運村以外飯店及村長辦公室乳制品特供工作。2009年，為國慶六十周年慶典提供乳品特供工作，擁有壹支嚴守政治紀律、嚴把供應流程，具有豐富特供經驗的特供隊伍。
三元食品始終熱心投入公益事業。自2000年開始，三元食品公司為在京的老紅軍戰士無償提供鮮奶至終生；2003-2007年，連續5年贊助平谷山區貧困學校，***計支持資金50余萬元；2007年，向安徽抗洪救災前線捐贈9萬箱牛奶，價值380萬元；2008年，汶川地震期間，向北京無償獻血者提供價值10萬元的牛奶，並為地震災區捐贈20萬箱鮮奶，價值1,000萬元。
三元食品的全體員工將加倍努力，本著“質量立市 誠信為本”的理念，以不斷滿足消費者需要為己任，真誠與社會各界合作，營造三元食品的輝煌未來。