扁鵲善於運用四診，尤其是脈診和望診來診斷疾病。《史記?扁鵲倉公列傳》中記述了與他有關的兩個醫案：壹個是用脈診的方法診斷趙子簡的病，壹個是用望診的方法診斷齊桓侯的病。
有壹次，他到了晉國（今山西、河北、河南壹帶），正碰到了晉國卿相趙簡子由於“專國事”，用腦過度，突然昏倒，已五天不省人事了。大夫（官名）們十分害怕，急忙召扁鵲診治。扁鵲按了脈，從房裏出來。有人尾隨著探問病情，顯得很焦急。扁鵲沈靜地對他說：“病人的脈搏照常跳動，妳不必大驚小怪！不出三日，他就會康復的。”果然過了兩天半，趙簡子就醒過來了。準確地用切脈診病是扁鵲的首創。著名歷史學家司馬遷高度贊揚說：“至今天下言脈者，由扁鵲也。”近代歷史學家範文瀾也說：扁鵲“是切脈治病的創始人”。
又有壹次，他路過齊國都城臨淄的時候，見到了齊國的國君齊桓侯。他看齊桓侯的氣色不好，就斷定他已經生病了，便直言不諱地對他說：“妳有病在膚表，如不快治，就會加重。”桓侯聽了不以為然，說：我沒病。”扁鵲見他不聽勸告就走了。這時，桓侯對左右的人說：“凡是醫生都是貪圖名利的。他們沒有本事，就把沒有病的人當有病的來治，以顯示本領，竅取功利。”過了五天，扁鵲又來見齊桓侯，作了壹番觀察之後，對齊桓侯說：“妳的病到了血脈，不治會加重的。”桓侯聽了很不高興，根本沒有把扁鵲的話放在心上。再過五天，扁鵲又來見齊桓侯，經過細致的觀察，嚴肅地對他說：“妳的病進入腸胃之間，再不治，就沒救了！”齊桓侯聽了很生氣，當然也沒有理睬扁鵲的話。等到扁鵲第四次來見桓侯，他只瞥了壹眼，就慌忙跑開了。齊桓侯發覺扁鵲不理睬自己，就派人詢問。扁鵲說：“病在膚表，用湯熨可以治好；病進入血脈，用針灸可以治好；病到了腸胃，用酒劑也能治愈。如今齊桓侯的病已經深入骨髓，再也沒法治了，我只好躲開。”又過了五天，齊桓侯果然病重，派人請扁鵲來治，扁鵲早已逃離齊國，而齊桓侯因誤了治病時機，不久也就死了。早在兩千四百多年前，扁鵲就能從齊桓侯的氣色中，看出病之所在和病情的發展，這是很不簡單的。所以，漢代著名的醫學家張仲景贊賞不絕地說：“余每覽越人入虢之診，望齊侯之色，未嘗不慨然嘆其才秀也。”
扁鵲不僅善於切脈和望診，而且善於運用針灸、按摩、熨貼、砭石、手術和湯藥等多種方法去治療各種病癥。有壹次，他和弟子子陽、子豹等人路過虢國，虢太子恰好患病，病得很厲害，人們都以為他死了。為此，全國正舉行大規模的祈禱活動，把國家大事都撂在壹邊。扁鵲找到了中庶子（太子的侍從官）問道：“太子患什麽病？”中庶子答道：“太子中邪。邪氣發泄不出去突然昏倒就死了！”扁鵲進壹步了解了太子發病的各種情況，就信心百倍地對中庶子說：”妳進去通報虢君，就說我能救活太子！”但中庶子不信扁鵲能“起死回生”，不肯去通報，而且嘲諷扁鵲說：“妳既無上古名醫俞跗的本事，反而說妳能救活太子，就是不懂事的嬰兒也會知道妳是騙人的！”扁鵲氣憤地說：“妳這是從竹管裏望天。老實告訴妳，我秦越人不等切脈、望色、聽聲、審察病人形態，就能說出病的部位。不信，妳試去看看太子，他此刻耳朵該會鳴響，鼻翼該會扇動，從其大腿摸到陰部也該是溫熱的。”聽到這裏，中庶子不禁目瞪口呆。因為扁鵲雖沒有見過太子，但通過多次詢問，對太子的病情已了如指掌，說得頭頭是道，說明他很有本事，不可小看。中庶子只得進去通報了。虢君得知消息，吃了壹驚，趕快出來接見扁鵲，說：“我久慕先生大名，只是無緣拜見；先生路過我這小國，幸虧主動來救助，這實在是寡人的幸運！有先生救助，我兒就能活命；沒有先生救助，就只有把他的屍體埋在山溝罷了。”說著，“流涕長潸”，哭得好悲切。扁鵲告訴虢君，太子患的是“屍厥”（類似今天的休克或假死）。於是，扁鵲叫弟子子陽磨制針石，在太子頭頂中央凹陷處的百會穴紮了壹針。過壹會兒，太子就蘇醒過來。接著叫弟子子豹在太子兩脅下做藥熨療法。不久，太子就能坐起來。再服二十天的湯藥，虢太子就完全恢復了健康。從此以後，天下人都知道扁鵲有“起死回生”之術。而他卻實事求是地說，並非他能把死去的人救活，而是病人根本就沒有真正死去，他只不過用適當的治療方法，把太子從垂死中挽救過來而已。
從以上病例看出，扁鵲已經綜合運用了我國診病的“四診”原則—望、聞、問、切。他自說：“越人之為方，不等切脈、望色、聽聲、寫形，言病之所在。”這話已經充分表明扁鵲在臨床上運用了“四診”的診法。
可以說，扁鵲奠定了祖國傳統醫學診斷法的基礎。難怪司馬遷稱贊他說：“扁鵲言醫，為方者宗。守數精明，後世修（循）序，弗能易也。”
他用壹生的時間，認真總結前人和民間經驗，結合自己的醫療實踐，在診斷、病理、治法上對祖國醫學作出了卓越的貢獻。扁鵲的醫學經驗，在我國醫學史上占有承前啟後的重要地位，對我國醫學發展有較大影響。因此，醫學界歷來把扁鵲尊為我國古代醫學的祖師，說他是“中國的醫聖”、“古代醫學的奠基者。”範文瀾在《中國通史簡編》稱他是“總結經驗的第壹人”。
在治學上，扁鵲不滿足於壹技壹法，而是根據客觀實際需要，精通壹科，兼通數科，做到壹專多能。比如，他到越國都城邯鄲，看到當地婦女患病較多，就在婦科病方面下功夫，當了“帶下醫”，治好了許多婦女的多年疾病；他到東周都城洛陽，看見當地許多老年人，患了視聽力衰退的疾病，就著眼於五官科疾病的研究，當了“耳目痹醫”，治好了許多老人的五官病，使不少老人從耳聾眼花中恢復了健康；他到了秦國首都鹹陽，看到當地兒童的發病率很高，就研究兒童發病原因，當了“小兒醫”，治好了許多兒童的多發病。由此可見，扁鵲不僅精通內科，還兼通兒科、婦產科、五官科，甚至外科；他在診斷上，不僅精通“切脈”，而且善於“望色、聽聲、寫形”；在治法上，不僅精通針灸，還善於用砭石、熨貼、按摩、手術、湯藥等。可謂是壹位多面手的民間醫生。
在上古，神權高於壹切。巫術占統治地位。到了扁鵲的戰國時代，醫巫已經開始分業。扁鵲在醫學研究道路上完全拋棄巫醫那條死胡同。扁 扁鵲曾明確宣告：“信巫不信醫”是“六不治”之壹。為了捍衛祖國的醫藥學，他不惜豁出自己的生命。當時，秦武王有病，召請名聞天下的扁鵲來治。壹天，太醫令李醯和壹班文武大臣趕忙出來勸阻，說什麽大王的病處於耳朵之前，眼睛之下，扁鵲未必能除。萬壹出了差錯，將使耳不聰，目不明。扁鵲聽了氣得把治病用的砭石壹摔，對秦武王說：“大王同我商量好了除病，卻又允許壹班蠢人從中搗亂；假使妳也這樣來治理國政，那妳壹舉就會亡國！”秦武王聽了只好讓扁鵲治病。結果太醫令李醯治不好的病，到了扁鵲手裏，卻化險為夷。在這場技術高低的較量上，扁鵲徹底戰勝了李醯。李醯自知“不如扁鵲”，就產生忌之心，使人暗下毒手，殺害了扁鵲。
千百年來，扁鵲深為廣大人民所愛戴和崇敬，人們稱他為“能生死人”的“神醫”。在他行醫經過的***約四千化裏的路途上，歷代人民為他建陵墓、立碑石、築廟宇、朝香火。在伏道村扁鵲廟的墻上，有這樣壹首詩，概括了他的壹生，同時寄托了人民對他的哀思： “昔為舍長時， 方伎未可錄。 壹遇長桑君， 古今皆嘆服。 天地為至仁， 既死不能復。 先生妙藥石， 起虢效何速！ 日月為至明， 覆盆不能燭。 先生具正眼， 毫厘窺肺腹。 誰知造物者， 禍福相倚伏。 平生活人手， 反受庸醫辱。 千年廟前水， 猶學上池綠。 再拜乞壹杯， 洗我胸中俗。”
扁鵲拜師也只是傳說。
根據典記，魏文王曾求教於名醫扁鵲：“妳們家兄弟三人，都精於醫術，誰是醫術最好的呢？”扁鵲：“大哥最好，二哥差些，我是三人中最差的壹個。”
魏王不解地說：“請妳介紹的詳細些。”
扁鵲解釋說：“大哥治病，是在病情發作之前，那時候病人自己還不覺得有病，但大哥就下藥鏟除了病根，使他的醫術難以被人認可，所以沒有名氣，只是在我們家中被推崇備至。”
“我的二哥治病，是在病初起之時，癥狀尚不十分明顯，病人也沒有覺得痛苦，二哥就能藥到病除，使鄉裏人都認為二哥只是治小病很靈。”
“我治病，都是在病情十分嚴重之時，病人痛苦萬分，病人家屬心急如焚。此時，他們看到我在經脈上穿刺，用針放血，或在患處敷以毒藥以毒攻毒，或動大手術直指病竈，使重病人病情得到緩解或很快治愈，所以我名聞天下”魏王大悟。
先不討論其它，那麽扁鵲至少有兩個醫術跟他壹樣高超的哥哥。扁鵲拜長桑君為師終成大家，他兩個哥哥的醫術又是從何處學來的呢？古代傳藝極其嚴格，有傳子不傳女，傳內不傳外的說法，長桑君就算破例讓扁鵲得起真傳，也不會到破例把壹身本領
獨傳給他們三兄弟吧。當然，在扁鵲拜師的的記錄中甚至也未提及這兩位哥哥。顯然，兩位哥哥另有名師，且醫術甚至比長桑君還要高。如此扁鵲為何不從他哥哥壹樣拜這個人為師呢。根據剛才的說法，這個醫術高超的人跟他兩個哥哥有直接的血緣關系才最合解釋。
如果扁鵲拜師只是後人的杜撰，那麽最合理的解釋是扁鵲的醫術來自家傳。