1999.12，北京三元食品有限公司被授予“中國食品工業優秀企業”稱號
1999-2001，三元品牌連續三年被評為北京市著名商標
2000.3，通過ISO9001國際質量體系認證
2001.5，北京三元食品股份有限公司被指定為“學生飲用奶定點生產企業”
2001.10，北京三元食品股份有限公司“乳品加工技術研究與新品開發”在國家十五科技攻關項目招標中中標
2001.8，三元牛奶被指定為第21屆大學生運動會專供牛奶
2001.12，北京三元食品股份有限公司被中國食品工業協會評為中國農業產業化經營20大龍頭食品企業之壹
2002.4，北京三元食品股份有限公司被授予企業文化先進單位稱號
2002.5，北京三元食品股份有限公司被評為外商投資先進技術企業
2002.6，北京三元食品股份有限公司被評為農行AAA級信用企業
2002.9，北京三元食品股份有限公司生產的液體奶被國家質量監督檢驗檢疫總局評為中國名牌產品