然而，隨著對三星堆遺址幾十年的研究，關於三星堆消失的原因有不同的解釋和說法。主要有地震和洪水。
地震論的觀點是，三星堆文明在遭受地震襲擊後，遭受了巨大的創傷，原本適宜的生存環境沒有了，這就迫使三星堆，人們不得不拋棄原來的家園，選擇其他地方生存。洪水理論也是如此。按照這種觀點，三星堆所在的巴蜀地區在古代雨水充沛，洪水災害應該在都江堰等水利工程出現之前就出現了，所以三星堆文明在壹次大洪水災害中消失了。當然，這兩種說法目前只是猜測，專家在考古發掘中也沒有發現洪水或地震的痕跡。
至於三星堆文明為什麽會突然消失，需要大量的發掘和科學分析才能得出結果。現在出土的很多文物都表現出壹定的規律，這些文物都有壹定程度的破壞，但是這些墓葬表現出壹定的規律。這些法律說明，他們離開三星堆的時候，並不是被非常緊急的情況所逼。所以，對於他們消失的原因，有人推測是因為三星堆文明因為利益的其他選擇，不得不轉移政治中心。
除了以上，我個人認為三星堆文明並沒有消失，而是融入了整個中華文明，成為其中的壹部分。
我說的這些，主要是基於三星堆文明與中原等文明關系密切。三星堆遺址出土的大量青銅器可以發現與中原地區同時期的殷商文明有相同或相似的文化符號，說明三星堆文明在當時並不是壹個封閉的社會體系，他們與中原文明有著很強的文化交流甚至貿易往來。因此，隨著時代和時間的變遷，三星堆文明逐漸融入了整個中華文明，但由於缺乏相應的文字記載，三星堆文明早期的具體歷史情況尚不得而知。