1、本質不同：專利代理師是壹個從業資格，是指獲得了專利代理人資格證書，持有專利代理人執業證並在專利代理機構專職從事專利代理工作的人員，而知識產權師是壹個崗位名稱，是指能在知識產權管理機構、大型企業、科研院所等單位從事知識產權管理工作事務的綜合性人才。
2、工作範圍不同：專利代理人主要從事“專利權”方面的內容，對“著作權”與“商標權”只需要有壹個普通的了解即可，而知識產權師要對知識產權的“著作權”、“專利權”、“商標權”這三方面均有較高的了解。