甲魚全身都是寶，它的頭、指甲、骨頭、肉、蛋、膽、脂肪都可以入藥。名醫別錄說甲魚肉有補中益氣的功效。據《本草綱目》記載，甲魚肉具有滋陰補腎、清熱化瘀、健脾健胃等多種功效。可治療疲勞盜汗、陰虛陽亢、腰酸腿痛、久病泄瀉、小兒癲癇、婦女閉經、難產。《每日本草》認為，龜血外敷可治療面部神經、中風口渴、疲勞潮熱、骨結核。龜血中含有動物膠、角蛋白、碘、維生素D等成分，能潛陽養血、消腫平肝，治療肝硬化、肝脾腫大，治療閉經、經漏、小兒癲癇。龜膽可以治痔瘡和漏。龜蛋可以治慢性痢疾。將龜頭焙幹研成粉末，用黃酒送服，可治脫肛。甲魚的脂肪可以滋養陰陽，治療白發。現代科學認為，甲魚含有豐富的維生素A、維生素E、膠原蛋白、多種氨基酸、不飽和脂肪酸和微量元素，能提高人體免疫功能，促進新陳代謝，增強人體抗病能力，具有養顏美容、延緩衰老的作用。但也有不適宜人群:由於胃黏膜水腫、小腸絨毛增厚縮短、膽汁分泌紊亂等因素，肝炎患者的消化吸收功能大大減弱。甲魚含有豐富的蛋白質，患者食用後不僅難以吸收，反而會增加肝臟的負擔。嚴重時會出現肝細胞大量壞死，血清膽紅素急劇升高，血漿濃度升高，誘發肝昏迷。
腸胃功能較弱、消化不良的人要謹慎食用。尤其是腸胃炎、胃潰瘍、膽囊炎等消化系統疾病患者。
失眠、孕婦、產後腹瀉者也不宜食用。