香港公司不能直接在中國運營。因為香港公司屬於境外公司，不具備境內法人資格，香港公司不能給境內公司開具正式發票。
在香港註冊的公司在內地經營需要辦理哪些手續？
1.在國內註冊的香港公司屬於回國投資，需要去外經貿委進行項目審批。壹般外資占註冊資本的比例不得低於25%，並要求以外匯形式從境外(離岸賬戶也可)進入驗資，然後到工商行政管理部門登記領取營業執照，最後辦理稅務登記。當然，有些行業需要政府部門特批，所以需要額外的工作。
第二，是設立代表處。雖然對母公司股東的國籍沒有要求，但是代表處只能用於聯絡和宣傳，不能用於經營，也就是只能花錢，不能有收入。所謂的大陸運營只是聯系壹些客戶或者供應商，根本不需要在國內註冊，最多註冊個辦公室就可以了！這是最方便、最經濟的方法。
三、另壹種方式是國內有壹家企業，用壹家香港公司授權給國內企業，國內公司將獨家代理香港公司在內地的業務。這種方式多用於借助香港公司名稱的客戶，因為在國內註冊公司有很多限制，而香港公司對名稱沒有限制，以協會、中心、研究會結尾都可以。
四、大部分客戶利用香港公司經營國際貿易，國內有公司需要進口或出口貨物，利用香港公司轉移貿易價格，從而進行合理避稅。這種香港公司在中國不需要有外地辦公地址和辦公人員，只是用來簽訂加盟協議。
以上是註冊香港公司在中國經營的幾種模式。
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卓誌會計師事務所專門從事全球離岸公司、香港公司、英國BVI公司、日本和新西蘭公司的註冊，以及國際認證和商標註冊。