福臨堂因其自身的管理風格受到了國家部委、省市報告和公眾的好評。1995年國內貿易部頒發“中華老字號”金匾，1996年國家醫藥管理局指定為“涉外供應試點藥店”，連年被有關部門評為“價格質量信得過單位”。經征詢消費者意見，被昆明日報、市技術監督局評為消費者心中的名牌。
雲南醫藥集團與香港世界中國工業項目有限公司合作，重新組建昆明福臨堂藥業公司。今天，福臨堂重視在繼承傳統的基礎上，將深厚的中醫藥文化與現代先進的管理理念相結合，形成獨特的企業文化。在經營上穩步發展連鎖經營，倡導八統壹:統壹采購配送、統壹服務標準、統壹銷售價格、統壹財務管理、統壹店面標識、統壹店面設置、統壹廣告、統壹質量標準，實施名牌戰略，弘揚福臨堂“福澤杏林”的初衷，用服務和愛心回報社會。
公司成立後，在繼承福臨堂優良傳統的基礎上，定位為連鎖經營。現在公司擁有40多家連鎖店，600多名員工，網點遍布昆明及部分地區。
目前公司設有九個部門(人力資源部、市場采購部、財務內審部、信息系統部、連鎖管理部、銷售批發部、中藥材生產部、倉儲配送部、質量管理部)，嚴格遵循連鎖經營模式，管理嚴格，人才隊伍素質高，為公司開拓新市場奠定了良好的基礎。
昆明福臨堂藥業股份有限公司現已成為國家醫藥產品管理局批準的首批41跨省藥品零售經營試點企業之壹，並經雲南省勞動和社會保障廳批準其38家連鎖店為“城鎮職工基本醫療保險定點零售藥店”，其5家藥店被昆明市醫保中心批準為“昆明市城鎮職工基本醫療保險定點零售藥店”。公司引進了先進的電腦化管理流程，建立了MIS系統，提高了管理效率，並與國內外知名網站建立了聯系，逐步實現了B2B、B2C的新型銷售模式。在全新的商業模式下，公司將依托信息社會的先進手段，在更大範圍內傳播福臨堂的經營理念。福臨堂的連鎖經營從雲南省擴展到其他省份和國外，逐步實現了中醫藥在世界範圍內的連鎖經營，弘揚了中國的醫學文化。
福臨堂的目標是樹立中華民族的品牌，把福臨堂發展成為面向全國、面向全球的大型醫藥連鎖企業，讓世界知道福臨堂這個“百年老店、正宗藥”的中華老字號，讓世界了解福臨堂，讓世界了解中國悠久的中醫藥文化！