在市場策劃與開拓上擬分三步走：即創新、創業與產業化三個階段，根據三個階段的內在規律和各校的相對優勢整體運作、相互聯系、相互協調，以“創新、創業、產業化”為壹個有機的整體，本著“統籌規劃、以人為本、市場推動、擴大開放”的原則組織實施。
1、創新研究
合肥國家大學科技園屬“多校壹園”的結構模式，“創新”階段以科研人員自主選題，結合學校教學和重點學科的方向，開展自主創新研究。
根據安徽省高新技術產業發展方向，組織開展信息技術、生物醫藥工程、環保工程、精細化工、納米新材料、清潔能源、現代農業技術等領域項目開展自主創新研究。增加先期投入，對首批入園三校以及安徽省醫科大學等高校中的有自主知識產權的項目進行開發研究，分階段孵化逐步成熟，力爭使之形成系列成果，形成優勢群體。合肥工大拓峰生物機電研究所自主開發的超臨界流體萃取、生物產品膜分離等技術，並由此產生六個系列十余種高新技術產品。幫助高校申報各類政府科技計劃，多渠道爭取支持。依托國家重點實驗室，如科大國家同步輻射實驗室、火災科學國家重點實驗室，合肥工業大學的網上IC設計中心、安徽大學的電能測試工程中心、安大皮革化工中心等實驗室的人力資源、設備資源和成果資源，組織課題攻關，使高校成為創新的源泉。
合肥國家大學科技園在對外開展橫向項目合作與聯系的同時，組織科技人員攻關，把人力資源優勢變成經濟優勢。
合肥國家大學科技園鼓勵並支持有產業化發展前景的國家863、超863計劃、973計劃、國家攀登計劃、國家攻關計劃、國家火炬計劃、國家星火計劃的科研項目，進行孵化，鼓勵課題組進行成果轉化和產業化。
引進資產評估、商標評估、技術作價評估、股權期權作價評估以及管理者權益等機制，對創新成果進行評價，包裝上市轉讓。
在省校、市校、校企聯合的基礎上，利用信息咨詢跟蹤服務方式，對企業進行會診分析。
2、孵化研究
合肥國家大學科技園不僅是科技成果孵化的核心基地，也是安徽省高新技術的中試基地、成果交易基地、科技管理人才培育基地以及高新技術企業孵化基地。壹方面創立優良的創業環境，吸引他們入園創業；另壹方面承擔高新技術成果中試孵化、評估、優化、轉讓、產業化的任務，前者是基礎，後者是提高，也是重點。 2000年，合肥國家大學科技園已從各高校篩選出可供孵化並有產業化推廣價值的技術成果15項，竭力推廣轉化。
對高校科技項目進行篩選，請專家咨詢委員會進行評估推薦。
與學校簽定孵化合同，註入孵化資金，使小試成果在原材料生產與產品化生產、試生產與工業化生產、粗放式生產與集約化生產、單壹品種與多品種產品、局部領域與多應用範圍領域、高能低耗與高效益等環節進行孵化試驗，以期取得高附加值的經濟效果。例如，安徽大學的“陽離子松香施膠劑”項目，經過中試孵化、評估和鑒定，不僅具有對原材料深加工技術潛力，而且能提高造紙、塗料產品科技含量，提高產品性能，降低成本，替代進口，並有利於環保及三廢處理。合肥工大電氣學院與機械汽車學院聯合研制的“電封閉汽車齒輪實驗臺”在替代進口，節能降耗方面取得了很好的成績，該產品在南汽、江淮汽車制造廠、江鈴汽車廠獲得了用戶好評。合肥國家大學科技園發展有限責任公司作為孵化主體，與安徽蕪湖市松香劑廠、蕪湖市造紙廠簽定合同，分別進行孵化中試研究，取得很好收益，使這項技術成熟的先進的科技成果能得到及時轉化和應用。
與安徽省科技產業投資有限公司建立長期協作關系，利用該公司的1.5億元風險資金，作為合肥國家大學科技園高新技術成果開發風險投資，從中試階段就開始先行介入，***同發展。
成果孵化成熟後，以知識產權方式，對外轉讓或進行產業化生產。
對科技人員進行市場管理、法律服務、經營運作、市場調研、標準化管理等培訓，提高他們的綜合素質；建立評估核算和定量核算，對中試成果中的加工機器、生產設備、技術流程、產品定型、技術改造和原材料替代的方法進行優化分析，降低物耗成本，提高科技成果的轉化效益。這是大學科技園創業孵化的兩個方面，缺壹不可。其孵化成果與否，關鍵在於思想觀念的轉變、企業文化理念和協作協同精神。
安徽省科技廳、安徽省教育廳、中國科學技術大學、合肥工業大學、安徽大學5家***同發起成立“合肥國家大學科技園發展有限責任公司”，首批註冊資金1500 萬元人民幣，以企業運作、市場化經營合肥國家大學科技園建設承擔創業中心的運作及項目孵化。根據公司發展需要逐步增資擴股，上市融資。
3、產業化
合肥國家大學科技園實現產業化分流，即孵化成熟的科技成果通過科技成果對社會推廣、作價入股、學校獨資、與外商合作等方式開展多形式的合作，本著誰投資誰收益，力求使孵化的成果及時地得到推廣應用，以市場經濟為導向，創造良好的經濟效益和社會效益。
在合肥國家大學科技園規劃框架內，制定出中國科學技術大學科技產業園、合肥工業大學科技產業園、安徽大學科技產業園三個園區規劃，使生產廠房布局合理、企業群體相對集中，完善企業法人治理結構，使校企分開、政企分開，減少重復與割裂，避免搞“大而全、小而全”，提高生產設備、場所的利用率，提高整體效益。
利用安徽當地的原材料資源，註入成熟的科技成果，采用嫁接法、合資合作生產。例如：安徽大學物理系的“用鐵砂制備永磁體、軟磁體”的項目，便采用現有的技術成果與馬鞍山、含山縣、金寨縣、懷寧縣的企業開展合作，利用當地豐富的鐵砂資源進行加工生產。合肥工大拓峰生物工程有限責任公司生產的超純銀杏內酯，就是利用安徽豐富的銀杏資源而生產的壹種高附加值的深受市場歡迎產品。
積極推動高校科技成果轉化和高新技術產業化，以大學科技園為媒介，促進金融資本與高校知識資本相結合，進壹步推動地方社會、經濟發展。這是合肥大學科技園辦園的指導方針，也是深化高等教育改革的必然。合肥大學科技園積極推進高新技術成果產業化，應與社會資本結合。下列入園十家高新技術企業，就是利用高校自主創新的科技成果，與社會資金結合，培育起來的高新技術企業。
項目名稱 主要產品
1.科大創新股份有限公司 新材料、電子信息產品
2.安徽中科大訊飛信息科技股份有限公司 語音合成產品
3.合肥兆峰科大藥業有限公司 蝮蛇降纖酶等
4.合肥拓峰生物機電工程有限公司 銀杏內酯系列
5.安徽宏宇新技術發展有限公司 MC尼龍管
6.合肥工業大學漢思軟件有限責任公司 醫院信息管理系統
7.合肥工業大學金屬復合陶瓷高技術有限公司 耐磨、環保節能構件
8.合肥工業大學力源工業控制有限責任公司 數控系統驅動器等
9.合肥安大科招精細化工廠 水乳型聚胺酯皮革
10.上海寶鋼安大電能質量有限公司 電能質量測試儀
這十家高新技術企業，是三所高校在自身優勢科技成果基礎上，通過與社會資本有機結合，培育並壯大起
來的高新技術企業，把科技優勢變成實實在在的經濟優勢，不僅使企業本身得到了發展，而且也使高校科研活動實現了可持續發展。