1，不同的地理位置
南通站位於中國江蘇省南通市崇川區永興大道，是寧啟鐵路的中間站。南通西站位於中國江蘇省南通市通州區。
2.火車時刻表是不同的。
南通站班次:有15次高鐵列車，如G1302、G2575、G2632、G2642、G2682等。共有23趟列車，如D5424、D5428、D5432、D5462、D2284等。城際航班55個，如C3812、C3788、C3766、C436、C3712等。
直達特快列車有Z139、Z140、Z51、Z52等四列。有K92、K138、K564、K1142、K1144等12次快速旅客列車。
南通西站:G1256、G1304、G3288、G8351、G8356等32趟高鐵列車。D4216、D2124、D2136、D3064、D5591等23趟列車。城際航班有C3812、C3795、C3858、C3860、C3862等26個。
3.建設的意義是不壹樣的。
南通火車站的正式開通，對改善蘇中蘇北地區對外交通條件，加快江蘇腹地經濟發展，完善華東鐵路網建設，方便蘇中蘇北地區人民出行具有重要意義。
南通西站作為滬蘇鐵路、童眼高鐵和至嘉甬高鐵的站點，也是國家綜合運輸通道上的壹個站點，在國家建設“四縱四橫”快速客運通道中具有重要的戰略意義。
南通西站的建成運營，為南通加快融入上海壹小時經濟圈提供了重要支撐，對促進長三角地區產業布局調整、實現區域資源共享具有積極意義。
南通站設計參數
截至2065438+2006年5月，南通火車站總建築面積為11740.6平方米，其中候車區3696.6平方米，綜合大廳1289平方米，售票廳369平方米。站前高架橋長312.76米。平臺配有500米長的天篷，沒有平臺立柱。無站臺柱雨棚鋼結構面積34737平方米，有1入口天橋和出口隧道。
南通站采用鋼管混凝土柱、型鋼混凝土梁、大面積玻璃幕墻結構、大跨度弧形鋼桁架結構。照明采用智能時間控制；中央空調采用地源熱泵系統，制冷采用球形噴嘴和旋流式風口送風，采暖采用地板輻射采暖。