法律分析：商標權使用費收入如何收取的確認方式：壹般情況下，商標使用權收費，由當事人自行約定；且該使用費壹般需要在商標許可合同中體現，並由商標局予以備案。
法律依據：《中華人民***和國商標法》 第四十三條 商標註冊人可以通過簽訂商標使用許可合同，許可他人使用其註冊商標。許可人應當監督被許可人使用其註冊商標的商品質量。被許可人應當保證使用該註冊商標的商品質量。經許可使用他人註冊商標的，必須在使用該註冊商標的商品上標明被許可人的名稱和商品產地。許可他人使用其註冊商標的，許可人應當將其商標使用許可報商標局備案，由商標局公告。商標使用許可未經備案不得對抗善意第三人。