病原體從恙蟎叮咬處侵入人體，先在局部繁殖，引起皮損，繼而直接或經淋巴系統進入血循環，形成立克次體血癥，在血管內皮細胞和單核吞噬細胞系統內生長繁殖，產生毒素，引起全身毒血癥狀和各臟器的炎性、變性病變。其基本病變為全身小血管炎、血管周圍炎及網狀內皮細胞增生，被恙蟎叮咬的局部皮膚先有充血、水腫，形成小丘疹，繼成小皰，然後壞死和出血，形成黑色痂皮(焦痂)。焦痂附近的淋巴結腫大。皮疹的發生是由於真皮內小血管炎，血管周圍炎或伴有出血，內臟普遍充血、肝脾腫大，並出現心肌炎、出血性肺炎、問質性腎炎、腦膜炎。