截至11月23日，和平之舟播至30集，分集劇情介紹如下：
第1集
大洋之上，壹艘印著紅十字的大白船緩緩駛過——中國海軍醫療船“和平方舟”正在執行和諧使命任務。突然警鈴響起，和平方舟接到上級命令——救援失聯多日的“菲爾號”漁船。確定漁船位置，高旗率蛟龍隊員全副武裝登船。船上狀況慘烈，不斷發現面容發黑的屍體，院長孫誠海根據同步的視頻畫面迅速做出判斷，船上不排除發生烈性傳染性疾病的可能。
第2集
“菲爾號”漁船救援任務順利完成，並與他國政府完成交接儀式。孫院長向葉南請求將張渡航留在和平方舟繼續工作，可張渡航卻想著早日回編隊轉業。另壹邊，路陽正在給眾醫護人員上“槍彈穿透傷的處理”的課程，張渡航落座後排，暗自在紙條上記錄著什麽。課後，張渡航讓姜俊波將紙條交給路陽，指出其授課內容中的錯誤。
第3集
葉南等人召開會議，商討“優雅號”船員處理方案，等待所屬國前來交接。此時“優雅號”船長因手術感染昏迷不醒，孫誠海讓張渡航進行再次手術，路陽表示自己嚴格按手術流程操作，因此困惑，埋頭研究槍傷手術。
第4集
葉南前去勸誡病房中的走私組織頭目，讓其不要再做傷天害理的事情，並表達中國海軍的為人之道。和平方舟即將靠岸，卻再次接到緊急命令。菲利國經受臺風災害，和平方舟受命前往當地執行人道主義醫療救援任務。
第5集
高英俊因暈船吐了，大聰與其聊起過往經歷，誇贊身為零零後的高英俊。此時前甲板艙口蓋松動，裏面物資如進水會有危險，大聰與高英俊接領任務，全副武裝，趕往前甲板。船艙外狂風驟雨，船身飄搖，大聰與高英俊奮力頂著風浪，壹步步艱難往前甲板艙口蓋挪動。
第6集
葉南與孫誠海找到華僑商人史先生相助，史先生將自己的房子提供出來作為前置醫院。葉南認為很可能會接收傳染病患者，因此謝絕好意，表示尋找不到合適的地方再回來。另壹邊，張渡航治療壹名肩膀脫臼的患者，成功治療後，終於有人願意跟海軍回和平方舟號治療，然而卻發生誤會，以為張渡航是騙子，眾人散去。路陽堅持發宣傳資料，可是沒人願意理睬。
第7集
葉南與大使商議，盡快與媒體接觸，以宣傳的方式消除與病人之間的隔閡，以便更多收治病人。孫誠海安排張渡航與路陽沿路發放物資，並接收病人至前置醫院，高奇隨同確保眾人安全。國內張渡航家中，居委工作人員小趙前來看望沈默，讓其服從組織安排去醫院。
第8集
張渡航與路陽深入村落巡視災情，此時壹處樓房坍塌，張渡航請求支援。老葉終於找到壹名吊車司機，然而吊車卻壞了。前方，路陽為傷著簡單治療，張渡航用千斤頂嘗試救援。此時傷者蘇醒，告知兒子也被埋了，眾人全力尋找。
第9集
日月流轉，災情漸漸得到控制，和平方舟援助任務圓滿完成，吳誌方和葉南商量菲利國軍需首長前來探望患者、參觀和平方舟的行程，因孫誠海病了，讓張渡航出面介紹情況。菲利將軍看望阿婆，阿婆手術成功恢復視力，再次見到了兒子的照片，將軍為阿婆兒子感到驕傲。
第10集
孫誠海安排沈默下周手術，可張渡航希望大家可以瞞著沈默病情，路陽提出不同意見。張渡航私下找到教導主任，說明沈默病情，並讓主任幫忙瞞著沈默。與此同時沈默常常忘事，主任找到沈默表示同意請假的事情。張渡航也同意沈默上完公開課再進行手術。
第11集
沈默手術很成功，可路陽卻累到睡著在了醫院，醒來時才發現顧宇峰壹直在醫院外等候。兩人回家，壹起吃蛋糕，看電影，看著看著，路陽在顧宇峰身旁睡著了。沈默醒來，張渡航無微不至的照顧在她身邊，還為她買了假發。
第12集
社區委員小趙替沈默買菜，看望沈默。孫誠海向首長請求調任張渡航，首長考慮張渡航家裏情況，同意調任，張渡航對此事也十分意外。712醫院內，常勝透露張渡航即將調來的消息，大家議論紛紛，許白則讓張渡航把握好機會。
第13集
另壹邊，汪鳴安慰失戀的路陽，路陽讓汪鳴替自己保密。飯後兩人分別，路陽獨自漫步在江邊，汪鳴回到和平方舟，得知又將出海，十分振奮。醫院內，孫誠海得到張渡航調任的正式通知，路陽也在最後關頭報名出海執行任務。
第14集
宋阿姨因臨時換主刀醫生，臨時反悔，許白送她回病房。另壹邊，孫誠海找路陽談話，整夜不睡，路陽表示自己正在調整，將顧宇峰錄制音樂的播放器給扔了，孫誠海默默撿起收好。
第15集
島礁之上，有村民被毒蛇咬了，路陽為其緊急處理，許白調用省醫院血清，可時間緊迫，賀昭利用中醫原理為患者清理毒素，總算控制住病情。葉南讓汪鳴等人購買雄黃處理場地。
第16集
路陽得知張渡航心結，拜托高奇帶來蛟龍隊曾經的合照，告訴張渡航堅持救人的選擇是正確的，讓他不必自責，張渡航看著合照痛哭流涕。沈默情況越來越糟糕，專家建議立即手術。張渡航去沈星的墓前，訴說起妹妹沈默的病情，答應沈星會把沈默照顧好。
第17集
在各位醫生的齊心協力下手術非常成功，沈默恢復得很快。她從醫護那裏得知“和平方舟”即將出發執行“和諧使命”任務，卻見張渡航沒做任何出航準備。沈默深知，丈夫除了肩負著軍人的責任，心裏也有未完成的使命。
第18集
吳誌方在剪頭發的時候，無意間了解到氣象參謀孫尚感冒的真實原因，是因為之前壹次氣象誤報落下了心病，所以轉天找到孫尚談心，解開了孫尚的心結，讓孫尚重拾信心。
第19集
夜幕降臨，將軍和夫人被葉南盛情邀請在“和平方舟”上用餐。將軍由衷地贊嘆，“和平方舟”不只是生命之舟，更是友誼之舟，願妳們平安航行，願世界各國都有妳們的足跡。眾人舉杯慶祝，氣氛熱烈。對於此次力薦常勝主刀手術，孫誠海問張渡航是怎麽想的。
第20集
政委來到船舷邊上，也掏出手機，手機屏保是自己女兒的照片，政委看著大海，看看手機裏的女兒照片，也開啟了自己對家人的思念模式。
第21集
孫誠海、路陽、張渡航等人查看瑪卡的病歷和影像資料。幾名來“和平方舟”開展醫療交流的曼蘇達醫生對瑪卡的病情也很熟悉，他們說就此事尋求過壹些國家知名專家的幫助，但因為風險太大沒有人願意給瑪卡實施手術。
第22集
但是，同壹時間，招待會餐飲開餐在即，竈臺的空壓機卻發生問題，有幾道菜還沒上齊。緊急關頭，維修、餐飲全體人員相互配合，吳誌方船長還上演了壹場精彩的“壹鴨三吃”的介紹，完美地解決了問題。
第23集
“和平方舟”圓滿完成在曼蘇達的所有任務。離港前，葉南率領醫院船所有官兵向誌願者致謝。為了讓孫誠海能有機會與女兒當面道別，船長吳誌方特別安排他為協助“和諧使命”醫療活動的誌願者頒發紀念證書。
第24集
壹名叫賽尼爾的老人因最愛的孫女露娜離世，萬念俱灰，說什麽也不願再接受治療。他掙紮著要離開醫院，眾人勸阻未遂，賽尼爾甚至奪了醫院的剪刀企圖自殺。唐詩上前阻止卻敵不過老人的力氣，危急時刻路陽壹把握住了剪刀，防治老人傷害到自己或者別人。
第25集
留在醫院的路陽和齊暖無法就是否給哈瑞婭實施剖宮產達成壹致，二人誰也不服誰。路陽覺得自己發現了問題及時指出，是在幫助齊暖；齊暖則認為路陽純粹是在出風頭打壓自己。張渡航和秦俊波在兩人之間來回斡旋。路陽接受建議，真誠地和齊暖聊聊。
第26集
小查都病情加重，路陽和齊暖等醫生，擔心用藥可能給小查都留下後遺癥等問題展開了激烈的討論。最後她們在權衡利弊之後，對癥用藥，同時中國醫生的方案也得到了當地醫生的支持和信任。
第27集
為了提升遠海衛勤保障能力，“和平方舟”組織開展全船全員的急救培訓，官兵們認真訓練，忙的不亦樂乎。可直升機小隊的隊長馬劍急著申請開展夜航訓練。船長吳誌方知道馬劍心裏的“小九九”，前兩次的夜間海上救護訓練都不太成功，他這是憋著壹口氣想要證明自己。
第28集
孫誠海讓張渡航和路陽聯合主刀，並叮囑二人：此事關系著中國海軍和國家形象，這臺手術十分關鍵。張渡航和路陽對視壹眼，相互鼓勵。毫無懸念，手術成功。全程觀看了手術過程直播的當地官員對兩位中國軍醫精湛的技術佩服得五體投地。
第29集
唐詩面對大面積皮膚燒傷的病人盧卡，給他鼓勵和幫助；傷員帕奇的眼睛出現了問題，不願意接受救助，“和平方舟”的軍醫常勝給與了他力量和勇氣。張渡航接手的傷者腿部損傷非常嚴重，已經到必須截肢的程度，但傷者才二十歲，不願意截肢，張渡航決定冒著風險，強行保肢。大家全神貫註，與死神爭奪生命。
第30集
“和平方舟”派出直升機救援小分隊。通過無線電，葉南和馬劍約定在村子的高處接應。葉南點起火把，為直升機定位，馬劍果斷放吊籃救人！路陽堅持讓村長弟弟先上直升機，可吊籃剛將傷員拉至半空，塑料廠老板剩余的私人武裝分子就趕到。他們對著直升機壹頓掃射。