1、遺傳因素
唇腭裂有遺傳傾向，往往唇腭裂患者的親屬也有類似的畸形，這是由於某種基因突變造成的。調查顯示，父親患有唇腭裂，後代患病率為3%左右；母親患病，遺傳給子女的幾率達14%。
2、母體因素
懷孕期間，孕婦若劇烈嘔吐或極度偏食，造成維生素A、B及鈣、磷、鐵、葉酸等缺乏，兔唇患兒的發生率相應升高。研究顯示：孕期適量補充葉酸，對預防先天性唇腭裂有壹定作用。
3、病毒感染
新生兒兔唇也與孕期病毒感染有關。可導致胎兒畸形的病毒有風疹病毒、水痘病毒、流感病毒、單純皰疹病毒等，特別是懷孕前三個月，若感染了這些病原體，可通過血液侵犯到胎盤及胎兒，形成宮內感染，影響胎兒正常發育，導致胎兒發生畸形。
另外，孕期用藥不當，如服用抗癲癇藥、類膽固醇、抗過敏、抗癌藥物等，可誘發畸形胎。
4、外部因素
兔唇的發生也與壹些外部因素有關，如孕婦照射X線、吸煙、酗酒、長期缺氧等，均可導致胚胎細胞突變，出現畸形。另外，年齡越大的父母，孩子患兔唇的幾率就越大。
5、唇腭裂的影響
唇腭裂不僅影響孩子面容及形象，引起自卑，帶來極大心理壓力；而且嚴重的兔唇還會影響嬰兒吮吸、發育，甚至會使嬰兒發生窒息。壹些未接受治療的兔唇兒童甚至無法像正常兒童壹樣接受教育。雖然目前可以針對唇腭裂做早期整形矯治，但並不是每個家庭都能承受高昂的費用，所以孕期的媽咪為了後代，應盡量避免上述的誘發因素。
6、如何預防唇腭裂
1、營養平衡：媽媽是胎兒唯壹的營養來源。在懷孕期，均衡而多元化的飲食是非常重要的。懷孕時吃和喝的壹切都會對嬰兒造成影響，要多吃蔬菜和新鮮的水果，少吃含糖份、鹽份和經過加工的食物。
2、情緒穩定：當孕婦出現憂慮、焦急、暴躁、恐懼等不良情緒時，腎上腺皮質激素可能阻礙胚胎某些組織的融匯作用，造成胎兒唇裂或腭裂。
3、疾病早治：有糖尿病、貧血、婦科病及甲狀腺功能減退疾病的孕婦，要盡早治療。
4、慎重用藥：懷孕期間應用激素或抗腫瘤藥物、抗組胺藥物，均可能導致胎兒畸形。
5、避免感冒：調查發現，很多唇腭裂兒母體在孕前期都感冒過，這也是導致唇腭裂的重要因素之壹。
6、防範病毒：孕期婦女應特別註意預防風疹等病毒感染。
7、遠離放射：青年夫婦在決定懷孕前3個月，要盡量避免接觸放射用品，現在許多孕婦壹直到生產都正常上班，許多辦公室都是開放性場所，堆滿電腦，幾十臺手機同時使用，對胎兒健康十分不利。
8、戒除煙酒：墨西哥壹項研究表明，“兔唇”是因為嬰兒在胚胎時期上唇和上腭的發育受阻，孕婦長期吸煙和酗酒導致胚胎發育異常是其中壹個原因。
9、掌握生育時機：醫生表示，20歲以下和35歲以上的父母產生畸形兒的可能性最大，因為20歲以下還沒完全成熟，而35歲以上已經開始老化，因此，女性最好在25歲至30歲之間生小孩。
10、重視婚檢產檢：結婚前最好通過婚檢進行第壹次篩查，發現唇腭裂等遺傳疾病。此外，胎兒20到24周時有經驗的醫生就可以從超聲波檢查中看出胎兒是否存在肢體殘缺等較明顯的畸形。