火影忍者原創劇情可以跳過，不影響劇情，具體集數如下：
1、26-27話1小時特別篇
2、66-67話1小時不間斷的佐助大暴走！特別篇
3、95-96話傳說中的三忍大活躍！1小時特別篇
4、101話想看想知道想確認卡卡西老師的真面目
5、110-111話木葉五人眾+狗狗！鐵壁陣型大活躍特別篇
6、116-117話今年繼續的火影忍者！冷酷男人的熱血戰鬥！天才忍者的大活躍特別篇
7、147-148話史上最強的火影忍者特別篇 大決戰 捉蟲 運動會 3大祭典大活躍
8、166-167話今年火影忍者仍將繼續！狗年卻是鳥之國！？不間斷的大活躍特別篇
9、202話本日發表！忍者們的充滿汗和淚水的經典5決鬥！番外篇也充滿精彩的特別篇
10、203-205話搬家紀念！即使是周四也不要錯過！愛與恨的師徒對決 上忍下忍亂入大活躍特別篇
11、214-215話寒冬中的熱血戰鬥！年度最後的大活躍特別篇
12、221-222話終於開始行動！火影忍者疾風傳特別篇
13、242-243話夏之陣火影忍者疾風傳特別篇
14、249-250話吹飛到異空間！火影忍者疾風傳特別篇
15、256-257話新生卡卡西班出陣！火影忍者疾風傳特別篇
16、260-261話戰鬥的時刻來臨！命運之火影忍者疾風傳特別篇
17、271-272話佐助登場！激動的火影忍者疾風傳特別篇
18、273-274話木葉新芽！火影忍者疾風傳特別篇
19、277-278話撕裂黑暗的鉤爪！烈風大作的火影忍者疾風傳特別篇
20、284-285話木葉完全封鎖！戒嚴態勢的火影忍者疾風傳特別篇
21、288-289話紅色查克拉！破壞和暴走的火影忍者疾風傳特別篇
22、296-297話大激戰！曉VS阿斯瑪班 決戰的火影忍者疾風傳特別篇
23、298-299話阿斯瑪之死！絕望與痛哭的火影忍者疾風傳特別篇
24、306-307話被托付的火之意誌，新術炸裂！火影忍者疾風傳特別篇
25、321-322話火影忍者疾風傳特別篇 三尾出現之章·鳴人VS紅蓮！
26、323-324話火影忍者疾風傳特別篇 三尾出現之章·封印大作戰！
27、339-340話火影忍者疾風傳特別篇 卡卡西外傳～戰場上的少年時代
28、347-348話火影忍者疾風傳特別篇 堅強毅力忍傳～自來也忍法帖
29、349-350話火影忍者疾風傳特別篇～潛入雨忍者村！自來也的決意
30、355-356話火影忍者疾風傳特別篇～流轉的結果！兄弟重逢
31、372-373話火影忍者疾風傳特別篇～鳴人的眼淚！重新振作的誓言
32、390-391話火影忍者疾風傳特別篇～大冒險！尋找第四代火影的遺產
33、493-494話火影忍者疾風傳特別篇 誓言之時～再見 豬鹿蝶！！
34、506-507話火影忍者疾風傳特別篇 秘話·綱手&雷影～二人的賭註
35、510-515話“力量”
36、566-567話火影忍者疾風傳特別篇 曉始動～通向青春的橋梁
37、596-597話火影忍者疾風傳特別篇 鳴人對機械鳴人～九尾強奪指令～
38、609-610話電影公映前特別篇 日向姐妹～不變的命運～
39、642-643話電影公映前特別篇 鳴人的對手～被繼承的事物～
40、647-648話火影忍者疾風傳特別篇 ROAD TO TENTEN～前往夢的世界～