主要區別是，科目分類不同、形態特征不同、產地生境不同，具體如下：
壹、科目分類不同
1、丹參
丹參，別名赤參，紫丹參，紅根。是管狀花目、唇形科、鼠尾草屬、丹參種植物。
2、黨參
黨參，別名黃參、防黨參、上黨參、獅頭參、黃黨等。是桔梗目、桔梗科、黨參屬、黨參種植物。
二、形態特征不同
1、丹參
多年生直立草本植物，根肥厚，外朱紅色，內白色，肉質，葉片常為奇數羽狀復葉，頂生或腋生總狀花序，苞片披針形，花萼鐘形，帶紫色，花冠紫藍色，花柱遠外伸，小堅果黑色，橢圓形，4-8月開花，花後見果。
2、黨參
多年生草本植物，有乳汁。莖基具多數瘤狀莖痕，根常肥大呈紡錘狀或紡錘狀圓柱形，莖纏繞，不育或先端著花，黃綠色或黃白色，葉在主莖及側枝上的互生，葉柄有疏短刺毛，葉片卵形或狹卵形，邊緣具波狀鈍鋸齒，上面綠色，下面灰綠色，花單生於枝端，與葉柄互生或近於對生，花冠上位，闊鐘狀，裂片正三角形，花藥長形，種子多數，卵形，7-10月開花結果。
三、產地生境不同
1、丹參
分布於中國河北，山西，陜西，山東，河南，江蘇，浙江，安徽，江西及湖南。生於山坡、林下草叢或溪谷旁，海拔120-1300米。
2、黨參
產中國西藏東南部、四川西部、雲南西北部、甘肅東部、陜西南部、寧夏、青海東部、河南、山西、河北、內蒙古及東北等地區。生於海拔1560-3100米的山地林邊及灌叢中。
以上內容參考?百度百科-丹參、百度百科-黨參