1、品類不同：特殊化妝品是相對於普通化妝品而言的，比較特殊的九個類別。分別是育發類、染發類、燙發類、脫發類、美乳類、健美類、除臭類、祛斑類、防曬類。而除了這9個類別以外的都是非特殊用途化妝品，俗稱普通化妝品。比如單純的潤膚水之類，祛痘、去皺、抗氧化等現在都算非特殊化妝品。
2、備案方式不同：特殊化妝品作為強調獨特效果的產品，所含的物質可以對人體產生影響，如果添加了違禁物質或者某些成分過量都可能會對人造成傷害。所以，國家對於特殊用途化妝品的審批很嚴格，相關產品上市前需要獲得行政許可批件，並在網上備案。非特殊用途化妝品需要在產品投放市場兩個月內在省級食品藥品監督管理網進行產品信息網上備案，備案信息經省級食品藥品監管部門確認，由國家食品藥品監管總局政務網統壹公布。兩者的備案信息分屬不同系統，特殊類采用的是註冊制，非特使用的是備案制。