(1)植物檢疫：香蕉枯萎病是國際上著名的檢疫對象。應嚴格控制病區的蕉苗外運。發現病株，立即燒毀。
(2)農業防治：
①選栽抗病品種和無病苗木。
②嚴格控制香蕉育苗場所的選址。嚴禁在發生疫病的果場附近開辦香蕉育苗場，開設香蕉二級育苗場必須距離香蕉黃葉病發生地公裏以外；宜選擇地勢較高、不受灌溉水流影響、無過往黃葉病等病害記錄、周圍防疫隔離設施完善的場地；提倡到山地設立香蕉育苗場。場地在最後確定前須經過植檢機構的嚴格驗收。發病嚴重蕉園可與甘蔗輪作1～2年。
(3)藥劑防治：清除病株後，在病穴及周圍土壤中施用石灰或福爾馬林消毒。用70%甲基硫菌靈超微可濕性粉劑1 000倍液，或50%苯菌靈可濕性粉劑1 500倍液，或50%混殺硫懸浮劑500倍液噴霧。
註：黃葉病熱帶第4型使用資料與巴拿馬香蕉枯萎病近似，尚不明確分型依據。蕉“艾滋”曾被報道做香蕉“癌癥” ，雖然黃葉病對殺真菌劑有抵抗力但可用生物防治已出現眾多抗黃葉病的香蕉品種，無需過度擔憂。