小兒皰疹性咽峽炎壹般的病程是7天左右，孩子患病後會出現發熱、咽喉出現皰疹、進食口腔疼痛等癥狀，多數是由腸道病毒感染導致。皰疹性咽峽炎也可以合並中樞神經系統感染，合並中樞神經系統感染以後孩子會出現反復高熱、頭痛、惡心、嘔吐、肢體抖動、嗜睡等情況。如果出現上述情況，需要立即到醫院就診，這種情況下整個病程是10天左右，具體時間要根據孩子病情的輕重判斷。
兒童患兒童皰疹性咽峽炎，咽後壁可見大小不等的紅色小皰疹，周圍有紅暈，破潰後形成小潰瘍。孩子被診斷為皰疹性咽峽炎後，首先要讓寶寶多喝水，註意隔離。同時，可以口服利巴韋林顆粒或者是蒲地藍消炎口服液，也可以給孩子使用利巴偉林噴霧劑或者是開喉利劍噴霧劑。