大秦帝國崛起於鐵血競爭的群雄列強之林，包容裹挾了那個時代的剛健質樸、創新求實精神。她崇尚法制、徹底變革、努力建設、統壹政令，歷壹百六十余年六代領袖堅定不移地努力追求，才完成了壹場最偉大的帝國革命，建立起壹個強大統壹的帝國，開創了壹個全新的鐵器文明時代，使中國農業文明完成了偉大的歷史轉型。 在這部堪稱鴻篇巨制的藝術佳構中，作家力圖藝術地再現，在禮崩樂壞，群雄逐鹿的戰國時代，面臨亡國之禍的秦國於列強環伺之下，從秦孝公開始，篳路藍縷，變法圖強，經過幾代君臣的不懈努力，最終掃六合而壹統天下的艱辛悲壯歷程。
第壹部《黑色裂變》
主要寫秦國由弱變強的崛起歷史，並穿插回顧秦早期歷史與六國歷史；中心事件是商鞅變法，中心人物是商鞅、秦孝公與戰國初期的壹批偉人名士。截止於車裂商鞅；以舊貴族復辟勢力擡頭、秦國命運重新陷入危機為結構懸念，引出第二部。（更多詳細內容請參看“同名電視劇《大秦帝國》第壹部”的“故事梗概”）
第二部《國命縱橫》
是秦國東出與六國縱橫爭雄史。以商地民眾按古老習俗厚葬商君為序幕，秦惠王重新與變法勢力結盟，鐵腕鎮壓舊貴族叛亂，並整肅朝局，破格起用忠實於新法的年輕官吏，形成了生機勃勃的新壹代權力，全力準備東出中原。神秘的鬼谷子門下又有兩位剛學成的新壹代名士出山，蘇秦、張儀的名字已經悄悄傳到了秦國的公府。 春日，洛陽王城郊外的蘇氏別莊來了壹位客人，張儀風塵仆仆從安邑趕來，拜訪同窗七年、情同手足的師兄蘇秦。雙傑聚酒評點天下，各謀大國，並約定：蘇秦謀秦，張儀謀魏、齊、楚，相互援手，***擔艱危。在蘇秦興沖沖準備入秦，向父親辭行的時候，壹生經商的老父只給了他壹句話：母國為根，理根為先。蘇秦知道，這是老父要他在出山前向天下昭示氣節。他改變初衷，先入衰敗破落的洛陽王宮去見周顯王。周顯王賜蘇秦壹輛王車，讓他去遊說戰國，為周人爭光。蘇秦與壹位美麗神秘的宮廷女官燕姬壹見鐘情。對獻給魏王的霸業對策已成竹在胸的張儀求見魏王，適逢路過大梁的孟子作客王宮，張儀舌戰孟子，惹惱魏王，遊說受挫。蘇秦離周後再入秦，張儀先遊齊再說楚，均遭受重大挫折而壹時鎩羽。
七國亂象大混戰，秦國新軍連續大勝，對山東六國構成強大威脅。蘇秦忍辱苦修三年，洞察天下大勢，重新入世提出合縱抗秦大戰略，在已成為燕國王後燕姬的幫助下，被燕文公封為武信君。從燕國突破，成功遊說六國結盟，被任為六國丞相，與戰國四公子合力組成六國聯軍，對秦國形成強大壓力。秦國危難覓賢，巧妙運動已經對破解合縱成竹在胸的張儀入秦為相。張儀提出連橫大戰略，主持秦國與山東六國展開了縱橫大爭。並贏得了秦國公主、執掌秘密機構“黑冰臺”的贏華和侍女緋雲兩個奇女子的愛情。
楚懷王羋槐頭腦簡單且剛愎自用。任用昭睢壹群舊世族。寵幸貪才縱欲的王妃鄭袖，排斥主張變法強國的大夫屈原。任命無能的子蘭為合縱聯軍主帥。六國聯軍攻秦，幾經較量，六國終因根基不穩內訌多出而頻頻失利，合縱宣告失敗。蘇秦為避禍回到燕國。戰爭中傷亡最重的是楚國， 楚王惱羞成怒，歸罪於張儀。遂重新起用屈原掌握兵權，發誓向秦國復仇。春申君立即北上燕國，請蘇秦入楚，準備發動第二次合縱。
剛剛經過大戰的秦國遣國書使割地求和。誰知楚懷王看了拍案大叫：不要割地，只要張儀！正當秦國準備舉國壹戰之時，剛從燕國出使歸來的張儀卻自請入楚。邦交如戰場，張儀與贏華冷靜周旋於楚國，終於化險為夷。剛剛恢復了大司馬職務的屈原從楚國變法與合縱的利益出發，派兵暗殺張儀未遂，卻險些造成張儀與蘇秦這兩個生死朋友間的誤會。在秦國的離間下，屈原再次被貶斥，壯心酷烈的屈原私自調集八萬楚國新軍，在楚國屈氏家族的支持下，貿然與秦軍決戰。兵敗，全軍覆沒。回到燕國的蘇秦險被野心家子之卷入陰謀泥沼，遂離燕入齊。幾經周折終於在齊推開全面變法。神秘退隱的燕姬也歷盡艱難追隨蘇秦潛入齊國，兩人終獲團圓。
正當張儀遊說六國，成功推行連橫親秦戰略的關鍵之時，秦惠王身患不明原因的“暮瘋癥”，張儀入齊尋求方士，恰遇蘇秦被舊貴族買兇殺害，兩兄弟生死相別。安葬蘇秦後悲痛而歸，秦國內政已經發生了奇怪變化；狂暴太子與長史甘茂結謀排斥異己，上將軍司馬錯被迫卸職隱退，張儀為免遭罷黜而徑自掛冠離秦退隱江湖。尚武狂秦武王率領大軍欲圖東滅洛陽，將秦國再度推向危險的境地……
第三部《金戈鐵馬》
以秦軍東進，洛陽周天子君臣驚慌迎接為序幕。連續展開兩場沖突：壹為秦軍東進開道的宜陽之戰，千夫長白起嶄露頭角；二為秦武王進軍洛陽，舉鼎暴死。
白起奉秦武王遺詔，率壹千鐵騎從陰山北上秘密進入燕國，克難克險，設計迎回在燕國做人質的少年王子嬴稷；甘茂與魏冄、白起等將士結盟，合力粉碎公子嬴離的奪位政變，擁立嬴稷（秦昭王）繼位；燕國主政大臣樂毅說服燕昭王結好秦國，送回嬴稷生母羋八子（宣太後）；羋八子撥亂反正廓清朝局，破格起用族弟魏冄為丞相，親自攝政穩定秦國。
號稱“東海青蛟”的齊閔王欲圖霸天下，鼓動山東六國連兵六十萬先機滅秦。秦國危難關頭，宣太後壹力破格起用白起為將，鏊兵中原，大破六國聯軍。燕國密謀攻齊復仇，白起統兵趁機再度東出，冬季大舉進攻河內，拔魏韓城三十余座，秦設河內郡。魯仲連為保全齊國，南下楚國尋求結盟抗秦。白起水陸並進奇襲楚國，奪彜陵，攻陷郢都，楚國被迫北遷，秦設南郡，壹舉成為戰國超強霸主。燕國秘密聯結五國，組成以名將樂毅為統帥的聯軍大舉攻齊，齊軍連敗，暴虐的齊閔王被亂民活剮！聯軍攻陷臨淄，五國回兵，燕軍獨占齊國全境，惟余即墨、莒城兩城堅守。名將田單即墨抗燕六年，終用火牛陣大破燕軍恢復齊國，齊燕壹齊衰落。
其後魏冄貪功，不顧白起反對，派秦軍大將胡傷率軍十萬攻趙，被趙奢第壹次擊敗，宣太後謝罪自裁，秦國君臣猛醒。趙國崛起的內幕揭開，趙武靈王強國變法的傳奇故事“胡服騎射”壹壹展現，秦國與趙國開始了長期認真地斡旋；飽受奸佞陷害的名士範雎入秦，助秦昭王罷黜魏冄，襄助秦昭王親政，提出“遠交近攻”大戰略，秦國形成新的合力；趙國與韓魏合謀，接受韓國飛地上黨，欲居高臨下壓制秦國，引起秦國警覺，秘密制定與趙國決戰上黨，歷時三年的“長平之戰”層層展開，趙國全部精銳五十余萬壹戰覆滅。戰後秦昭王進入晚年，逼白起自殺，範雎心懷憂懼，更難者在於太子孱弱多病且無嫡子，諸王子皆平庸無能，連選賢另立的可能都很渺茫，秦國王室第壹次陷入了後繼無人的危機狀態，從而引出第四部。
第四部《陽謀春秋》
第四部是秦國連續度過三次交接危機的驚險低谷史。以蔡澤入秦路遇相學名家唐舉預言命運拉開序幕，故事叠次展開：蔡澤錯以急流勇退的自保之道說範雎，反遭範雎蔑視，唐舉密見老友，介紹蔡澤的計然富國才能，範雎上書舉薦蔡澤為相，決然辭官隱退，與魯仲連路途相遇壹起南下遊歷；魯仲連領引範雎在陳城結識呂不韋，引出呂不韋的商旅人生；呂不韋北上邯鄲，巧遇秦國人質王子嬴異人而雄心大動，最終決意棄商從政，呂氏傳奇由此展開。
呂不韋以雄厚資財入鹹陽周旋，使公子異人成為太子嫡子；趙國平原君警覺人質逃走率軍追殺，呂不韋得百名義士血戰掩護，方與嬴異人歸秦。秦昭王病逝，老太子嬴柱（秦孝文王）繼位壹年又病逝，異人（秦莊襄王）繼位，任用呂不韋為丞相推行新政；莊襄王在位三年病逝，此前已經迎回的十三歲少子嬴政繼位，呂不韋以“相父”身份與太後***同攝政；期間呂不韋兩次主持交接大局、穩定朝野、拓展國土，聲望大增，但與太後趙姬之曖昧糾葛卻惹來王族元老非議；呂不韋以非常手段解脫自己，使胡人嫪毐與趙姬私通，趙姬以攝政太後權力封嫪毐為長信侯，專權淫亂宮闈，蓄謀政變奪位，釀成秦國歷史上的最大醜聞。
少年嬴政與呂不韋聯合，壹舉鏟除嫪毐叛亂勢力，貶黜太後回趙國原籍；嬴政二十壹歲親政，呂不韋為消弭秦國法制的峻猛重刑，召集門客作《呂氏春秋》確立雜家治國方略；個性強悍的嬴政堅持商鞅法制，與呂不韋政見嚴重對立；呂不韋決意公布《呂氏春秋》，欲以朝野公議決定治國方略；秦王嬴政面臨巨大壓力，與青年李斯、王翦、蒙恬等新銳勢力結成護法同盟，圖謀對抗呂不韋集團，秦國又壹次面臨轉折危機，引出第五部。
第五部《鐵血文明》
第五部是故事容量最飽滿的壹部，也是全書最高潮。
以呂不韋於鹹陽四門張掛《呂氏春秋》，公然懸賞改壹字賜千金拉開序幕，李斯、蒙恬與呂不韋門客城下論戰，公開駁斥《呂氏春秋》，引發朝野大論爭；秦王嬴政以“壞法亂政，蠱惑國人”之罪罷黜呂不韋，呂不韋被迫自殺於洛陽。
此後正式拉開帝國創建大幕，展開四大階段故事：第壹階段整肅軍政，超拔新銳，壹大批年輕將領與主政大臣形成新生代勢力，同時大力建設秦國腹地的水利工程鄭國渠，使秦川成天府之國；第二階段展開統壹中國的連綿大戰，展開六國逐壹滅亡的故事；第三階段 ，統壹架構華夏文明體系，發動徹底驅趕匈奴的陰山大戰，建立萬裏長城與其他大型工程；第四階段秦始皇勤政巡視天下，積勞成疾而依賴方士奇術救治，深感人生苦短，遂生求仙長生之心，第六次巡視時突然病重，死於巡狩途中（沙丘）。秦國出現巨大的權力真空，野心與陰謀蠢蠢欲動，引出第六部。
第六部《帝國烽煙》
秦始皇驟然客死沙丘拉開序幕，趙高、胡亥密謀政變，總領國政的功勛丞相李斯被利誘挾持加入密謀，終使人才濟濟久經錘煉的秦帝國最高層權力發生巨大分裂。
其後扶蘇被逼自殺，掌握軍權的蒙氏兄弟被害，胡亥稱帝，趙高領政，秦帝國權力倏忽發生質變。二世集團殘殺帝國功臣元勛，鏟除皇室異己勢力，推行壹系列暴虐昏政，大大激化了秦始皇時期潛藏的各種社會矛盾。
其後陳勝與吳廣大起義爆發，六國舊貴族趁勢而起，形成天下反秦的燎原之勢。帝國對農民軍作戰勝利，但對以六國舊貴族為根基的反秦勢力卻反攻失敗。隨後劉邦與項羽皆進入鹹陽，風雨飄搖的帝國宮廷再次政變，胡亥趙高集團壹朝覆滅；恢復秦王稱號的子嬰投降，秦帝國政權終結。項羽大軍將帝國財貨擄掠凈盡，而後大火焚燒鹹陽宮三月不滅，整個關中成為八百裏廢墟，大秦帝國驟然灰飛煙滅。