壹、定義不同：
1、無創胎兒遺傳標記，是利用新壹代DNA測序技術對母體外周血中的遊離DNA片段（包含胎兒遊離DNA）進行測序、生物信息分析，從中得到胎兒的遺傳信息，並與假定父親的DNA信息進行比對，實現確認親子關系。
2、產前親子鑒定還包含羊水鑒定及胎兒絨毛鑒定。普通產前鑒定是鑒定生育能力是否正常。
二、作用不同：
1、胎兒親子鑒定的手續並不繁瑣，壹般的程序就是預約—驗明身份—采樣—鑒定—報告反饋。需註意的是：絨毛活檢手術要從下陰道走針，白帶清潔度要高，不然容易引起宮腔感染；還要檢查血常規檢測，白細胞不高就可以做。
2、無創親子鑒定就是聯合醫學無創孕期親子檢測，是利用最新DNA測序技術，對孕婦外周血中的遊離DNA片段進行測序和生物信息分析，從中獲得胎兒的遺傳信息，並與假定父親的DNA信息進行比對，根據孟德爾遺傳規律，確認胎兒與假定父親之間的親子關系。