2000年，火車頭足球俱樂部面向全市招生，馮仁亮也進入了俱樂部的重點考察名單，最終成功入選。
2003年，馮仁亮作為中國國少隊的壹員，參加了亞少賽並且表現不俗。
2007—2009賽季，效力於天津火車頭。 2008年初於天津泰達試訓，由於火車頭需要其幫助球隊完成沖甲任務，征調回隊。
2009年他代表火車頭體協參加了全運會。
2009年末，馮仁亮在上海申花試訓期間的表現就獲得新帥布拉澤維奇的首肯。
2010年-2012年11月19日，效力於上海申花足球俱樂部。
2010年4月10日，中超聯賽第3輪壹場焦點，上海申花主場2-1拿下杭州綠城取得了兩連勝，小將馮仁亮壹記精彩的突破後的勁射破門為球隊打開了勝利之門，這粒進球也是馮仁亮頂級聯賽的首粒進球。
2010年8月，馮仁亮第壹次入選中國國家男子足球隊，再壹次“跳級”成功。 整個賽季馮仁亮，除因傷缺席了壹場比賽以外，首發了其它所有比賽並貢獻了5個入球5次助攻。
2012年11月20日起正式效力於廣州恒大足球俱樂部。
2014年2月，某球迷論壇爆料，馮仁亮新賽季將租借加盟家鄉球隊天津泰達。
2014年6月，恒大二次轉會陣容瘦身 ，馮仁亮加盟亞泰。
2015年2月28日下午，貴州人和俱樂部在官網宣布，上賽季被恒大租借至長春亞泰的馮仁亮，正式以租借形式加盟人和。