1、獲得方式不同，石磨面粉是通過使用石磨磨碎麥粒，將麥粒的外皮磨掉，以保留更多的麥胚和麥芽，產生壹種粗糙而有紋理的面粉。相比之下，全麥粉也包括麥粒的外皮，但是其是通過碾磨或研磨進程獲得的。
2、口感不同，因為石磨面粉具有相對較高的麥胚和麥芽含量，通常比全麥粉稍微粗糙，但同時也更具有口感和營養價值。全麥粉含有未被去除的麥粒外皮，因此其營養含量更豐富，但通常口感相對粗糙。