應當區分不同的情況，如果是小規模納稅人的企業員工出差住酒店，可以選擇開增值稅普通發票，因為小規模納稅人采用簡易計稅辦法，不得進行進項抵扣；如果是增值稅壹般納稅人的企業員工出差住酒店，應向酒店索取增值稅專用發票。
法律依據：《中華人民***和國增值稅暫行條例》第十壹條，小規模納稅人發生應稅銷售行為，實行按照銷售額和征收率計算應納稅額的簡易辦法，並不得抵扣進項稅額。應納稅額計算公式：
應納稅額=銷售額?征收率
小規模納稅人的標準由國務院財政、稅務主管部門規定。
《中華人民***和國增值稅暫行條例》第二十壹條，納稅人發生應稅銷售行為，應當向索取增值稅專用發票的購買方開具增值稅專用發票，並在增值稅專用發票上分別註明銷售額和銷項稅額。
屬於下列情形之壹的，不得開具增值稅專用發票：
（壹）應稅銷售行為的購買方為消費者個人的；
（二）發生應稅銷售行為適用免稅規定的。