基因山小伯爵
生日：6.18宏觀世界和微觀世界結合的產物，性格開朗，武功卓絕，他的兵器螺旋棍 （又可變成“螺旋鞭”）是微觀世界最神奇的武器。他是正義的化身，被稱為“復仇小天使”，肩負著摧毀薩斯病毒的神聖使命。開場時以“鐵罩人”的形象登場。
智慧小魔女
生日:12.27真核魔幻城的統治者，具有統治微觀三界的野心，但良心未泯。她的兵器是幻音魔笛，雙目漣漪波是她的絕技。
青眉小管
生日：3.30
真核魔幻城青黴族，特警總部少年特警，曾作為放走鐵罩人和侏儒薩的嫌疑犯受到通緝，後協助小伯爵完成神聖使命。
他的兵器是伸縮自如的長絨鞭。他最大大的苦惱是患有“少女恐懼癥”。
林惕沙
生日：7.27
宏觀世界和微觀世界結合的產物，少年特警，“幻影005”童子軍的首領，率領隊員協助小伯爵完成神聖使命。林惕記的親兄弟。T形飛刀是他的獨門秘器，絕招幻影真身。林惕記
生日：7.27
宏觀世界和微觀世界結合的產物，少年特警，“幻影005”童子軍成員之壹，率領隊員協助小伯爵完成神聖使命。林惕沙的親兄弟。
林碧記
生日：5.20
觀世界結合的產物，少年特警，“幻影005”童子軍中唯壹的女性。她的兵器獨眼怪球，既具有攻擊力，也具有判斷是非曲直的能力。林碧漿他的兵器就是變化莫測的雙袖，他的“雙袖功”令微觀歹徒聞風喪膽。
單小寶
“幻影005”童子軍成員，他的兵器是兼具攻擊性又能開啟密碼的吻蛙，他的偽足功也是克敵制勝的法寶。
葉飄
綽號“桿兄”，是宏觀人類派往微觀世界的科學家，肩負著研究微觀三界擬人形，探究薩斯變異規律的重任，最然遭遇壹些挫折，但是最終圓滿完成了任務。
韓冰
綽號“肥兄”，葉飄到微觀世界的同伴，但他不知道葉飄的使命，是以旅遊者的身份進入微觀世界的。
薩斯王
病毒聯邦湊合國的首領，薩氏兄弟之父，綽號“K”爺，他具有稱霸微觀三界的野心。狼牙突（薩斯球）是他的兵器，“邪毒陰風”和“變身大法”是他的獨門絕技。若變身為代號擬人形，他的功力可增加壹倍。
侏儒薩
病毒聯邦湊合國薩斯族，薩斯王之子，在薩氏十二兄弟中排行老大。他臭名昭著，惡貫滿盈，不僅受到正義勢力的追捕，也是惡勢力爭相抓捕的對象。
侏愚泡
病毒聯邦湊合國薩斯族，薩斯王之子，在薩氏十二兄弟中排行老三。
侏愚蛋
病毒聯邦湊合國薩斯族，薩斯王之子，在薩氏十二兄弟中排行老五。
侏愚輪
病毒聯邦湊合國薩斯族，薩斯王之子，在薩氏十二兄弟中排行老八。
侏愚球
病毒聯邦湊合國薩斯族，薩斯王之子，在薩氏十二兄弟中排行第十。曾在病毒城的擂臺賽上連敗眾多高手，後被林惕沙的壹柄飛刀擊敗。被擊敗後，他神秘地失蹤了。、
侏愚卵
病毒聯邦湊合國薩斯族，薩斯王之子，在薩氏十二兄弟中排行老九。
陰官員、七星主
原核七星州七星族，原核七星州的實際統治者，妄想成為微觀三界的霸主。他的獨門秘器是具有殺傷力的七星寶輪。他曾綁架小魔女的父親真菌客，並通過施迷藥等手段控制了小阿，但小阿壹直沒見過他的真面目。在外人面前，七星主以“陰官員”的身份出現
小阿
宏觀世界和微觀世界結合的產物，曾是基因山小伯爵的助手之壹，後脫離小伯爵做了七星州聯合會的秘書長。他野心很大，企圖以稱霸七星州為起點，進而稱霸微觀三界。他的兵器也是螺旋棍的壹些功能，但威力遠遜於小伯爵的螺旋棍。