凡是藥都有副作用，只是程度不同而已。壹般來說，中藥的副作用沒有西藥的大，反應速度也沒有西藥快，故它不容易危及人的生命。但有少數的中藥毒性也很大，如使用時稍不註意，也會危及人體生命的。
首先，不良反應出現最多的是川烏。中醫認為川烏具有祛風除濕、溫經止痛的功效。它是治療風濕性關節痛的常用中藥。它的主要成分是烏頭堿。研究表明，如果烏頭堿攝入過量，可引起心臟毒性和神經毒性。木通也是不良反應中出現概率較高的中藥之壹。
另壹類出現不良反應較多的是雷公藤。雷公藤具有活血化瘀、清熱解毒的功效。且現代研究發現，雷公藤中含有多種高效的抗癌成分，包括雷公藤甲素、雷公藤紅素等，能夠使人體產生毒副作用。目前其毒副機理尚不完全清楚，但其對肝臟、腎臟、腸胃、血液、免疫系統、生殖系統均有壹定的損害，尤其會影響生育，因而限制了它在臨床上的應用。
事實上，幾乎所有的藥物都有可能造成身體傷害，中醫從來沒有否認或忽視這些潛在的危險。這也是中藥通過配伍、調整劑量和加工來確定處方，從而降低中藥毒副作用的原因。在漫長的歷史中，中草藥確實發揮了其獨特的作用，受到了國內外醫學界的青睞。然而，只有正確使用藥物，它們才能產生治療效果。使用不當會產生毒副作用。因此，只有正確認識中藥，使用中藥，才是至關重要的。