吉爾伯托的職業生涯開始於巴西國內的裏約熱內盧美洲隊，此後又先後在弗拉門戈、克魯塞羅隊效力。1999年吉爾伯托加盟意大利國際米蘭，不過僅壹個賽季之後他就重回巴西，此後的幾年他又在巴西國內的瓦斯科達加瑪、格雷米奧、聖卡塔諾等隊效力。
2004年吉爾伯托再次來到歐洲，加盟德國柏林赫塔隊，此後的四個賽季他為赫塔隊出場101次打進14球。2008年年初吉爾伯托加盟英超托特納姆熱刺隊，半個賽季出場10次打進1球。
2009年吉爾伯托回到巴西再次加盟克魯塞羅，在這裏他改踢前腰位置，前9場比賽打進5球。