99式主戰坦克的底盤借鑒了前蘇聯T-72主戰坦克底盤，戰鬥全重超過51噸，火炮向前時車全長約10米，車長7.6米，寬3.5米，高2.37米。與以往的國產坦克相比，99式主戰坦克的幾何尺寸增大許多，為容納125毫米火炮、大功率發動機、先進火控系統等提供了條件。
99式主戰坦克的車重到達51噸，加上大量應用復合裝甲，防護水平比起80系列坦克有了質的飛躍，達到西方第三代主戰坦克的水平。
99式主戰坦克采用了傳統的坦克布局，從前往後艙室依次是駕駛艙、戰鬥艙和動力艙。99式主戰坦克的駕駛員位於車體前部正中，車長和炮長位於戰鬥艙，炮長在左，車長在右。動力傳動艙在後，和戰鬥艙用裝甲甲板隔開。
與我軍傳統坦克不同，在外觀上，99式的炮塔沒有采用蘇式傳統的卵形鑄造炮塔，而是采用焊接結構的西方式炮塔。
在復合裝甲的時代，焊接炮塔開始展現優勢，因為比起T-72的卵形鑄造炮塔，焊接炮塔利於布置大厚度、大傾角的復合裝甲模塊。M1A2、豹2、挑戰者等西方三代坦克正是因為采用焊接炮塔，確立了對T-72、T-80坦克的防護優勢。