1、設施方面。南京九中有數字化教室，實驗室，多功能教室，圖書館等，可以方便學生學習，而南京五中不設有多功能教室。
2、教師方面。南京九中的教師團隊和教學水平壹流，老師采用的是科學高效的教學方法，而南京五中教師學歷普遍為普通本科學歷，教學水平普通，因此南京九中好。