化膿性腦膜炎常見致病菌與患兒年齡關系密切。化膿性腦膜炎常見的致病菌有腦膜炎雙球菌、流感嗜血桿菌、大腸桿菌、肺炎雙球菌、葡萄球菌等，其中腦膜炎雙球菌、流感嗜血桿菌最為多見。新生兒及小於2個月的患兒以革蘭埃希陰性細菌為主，如大腸埃希菌、副大腸埃希菌等。