夜間孩子的迷走神經興奮：小兒晚上睡覺咳嗽厲害與人體在夜間迷走神經興奮性增高，同時大腦皮層對於大腦的抑制減弱有關，可由心臟和肺部壹些疾病導致夜間咳嗽加劇。
睡眠時膈肌升高及呼吸道分泌物增多：小孩夜間咳嗽比較厲害，是由於小孩子多以腹式呼吸為主，夜間睡眠平躺膈肌升高，使得胸腔壓力增加，同時夜間呼吸道分泌物停留在呼吸道中，受呼吸刺激，自然會引發反射性咳嗽。
引起小兒夜間咳嗽加劇的主要疾病引起小兒晚上睡覺咳嗽厲害的肺部疾病，有急性感染性喉炎、支氣管哮喘、肺結核、氣管炎、肺炎、百日咳等。
支氣管哮喘：因為外界環境因素所誘發如動物皮毛、花粉、氣候發生改變、藥物或過敏食物等，引起呼吸道的超敏反應，突然喘息、憋氣、咳嗽等癥狀，尤其是晚上咳嗽伴有氣喘和哮鳴音。
當孩子出現支氣管哮喘時，要及時遠離過敏原，在醫生指導下明確診斷，合理用藥，控制哮喘。脫敏是治療哮喘的特殊治療方法，能改變哮喘病程，防止癥狀惡化。
痙攣性咳嗽：孩子出現痙攣性咳嗽，多是因為急性喉頭水腫或受到刺激所引起的咳嗽，主要表現在劇烈性幹咳，咳嗽時面部通紅、呼吸出現吸氣性困難。急性感染性喉炎壹般起病急，以犬吠樣咳嗽和三凹征等為主要表現。嚴重時可出現嘴唇發紫、煩躁不安、面色蒼白等。壹般白天癥狀輕，夜間入睡後加重。另外，就是氣管異物，表現的刺激性陣咳；家長要仔細觀察，及時清除口腔和鼻腔中的嘔吐物，若出現嗆咳、呼吸困難要及時急救處理。
支氣管肺炎：各種病毒、細菌、支原體感染引起的呼吸道急性感染，常常發生在寒冷冬季。早期咳嗽為幹咳，伴有煩躁不安、發熱及嘔吐，呼吸變得急促，有喘鳴音，恢復期咳痰較多。不論是哪種肺炎，家長都應該積極去醫院診療，更不可擅自用藥，因為妳沒有搞清楚病原體，用藥只能是盲目的，同時，不能早期鎮咳處理。
百日咳：在5歲以下的兒童多發，咳嗽最典型的表現是持續的痙攣性咳嗽，並帶有“悾悾”的犬吠樣咳嗽；孩子咳嗽劇烈時，可伴有大小便失禁、面紅耳赤和嘴唇發紫癥狀。而且咳嗽時間長達“百日”。
總而言之，兒童夜間咳嗽嚴重，是由以上疾病引起的，病加之孩子壹旦呼吸道疾病分泌物增加，膈肌擡高，夜間迷走神經興奮，支氣管痙攣，等原因導致孩子夜間往往比白天咳嗽、咳痰多。