問題如下：
這次蘋果iPhone 6和iPhone 6 Plus采用了全金屬超薄機身設計，擁有出色的持握手感。不過國內外媒體卻相繼反映iPhone 6和iPhone 6 Plus在口袋中容易彎曲的事實。甚至有網友直接錄制視頻演示徒手掰彎iPhone 6。
根據BGR調查顯示，“染色門”已經成為iPhone 6用戶面臨的新問題。論壇中壹些網友反映，由於頻繁在牛仔褲兜裏拿手機、裝手機，iPhone 6會變成藍色。染色的區域主要集中在淺色的天線上，這是因為天線部分的材質為塑料擋板。
據壹部分用戶反饋，蘋果iPhone 6手機外殼與屏幕之間的縫隙很大，這使得iPhone 6在打電話時很容易夾到頭發或胡子。
這次蘋果iPhone 6和iPhone 6 Plus都采用了2.5D弧形玻璃，手感確實有提升，不過易碎程度比起以往也更嚴重。有網友陸續曝光了手機不慎摔碎後的慘烈畫面。
工藝復雜的Touch ID也沒能幸免，也有用戶表示指紋識別的靈敏度會不定時的出現問題。這主要是因為蘋果在發布iOS 8.0.1時的粗心造成的後果。
美國壹名用戶PhillipLecther遭遇了壹場交通意外事故，當時並未被甩出汽車，而是被沖擊力推到車門上，這導致放在口袋裏的iPhone 6彎曲起火，造成大腿二級燒傷。