妳可以邊申請證件邊裝修，但是那個《消防檢查合格證》，需要先裝修好之後才能找消防部門申請現場檢查的，建議妳提早找當地消防部門指導妳如何裝修旅館的消防系統，否則妳完全搞好裝修之後再去重新做消防系統的話，很麻煩的。
大概的證件如下：
1、公.安部門的《特種行業經營許可證》，因為旅業屬於特種行業，所以需要這個證
2、消.防部門的《消防檢查合格證》，想要取得《特種行業經營許可證》，找個消防檢查壹定要通過才行
3、衛生部門的《衛生許可證》，旅館屬於公***場所，所以需要《衛生許可證》
4、工商部門的《營業執照》，做生意，都是需要營業執照的啦
5、稅務部門的《稅務登記證》，按章納稅是公民的義務
p.s.如果妳旅館還賣食品，那麽還得到工商部門辦理《食品流通許可證》，如果還做快餐飯市，那麽要去食品藥品監督管理局辦理《餐飲服務經營許可證》