血液流經腎小球時，血液中的尿酸、尿素、水、無機鹽和葡萄糖等物質通過腎小球的過濾作用，過濾到腎小囊中，形成原尿。 當尿液流經腎小管時，原尿中對人體有用的全部葡萄糖、大部分水和部分無機鹽，被腎小管重新吸收，回到腎小管周圍毛細血管的血液裏。原尿經過腎小管的重吸收作用，剩下的水和無機鹽、尿素和尿酸等就形成了尿液。 尿的排出：這是壹個極其復雜的生理過程。水液來源於飲食，是通過胃、脾以及大小腸等消化吸收而生成。水液的代謝過程，則是以脾、肺、腎三臟為中心完成的。故曰：“脾土主運行，肺金主氣化，腎水主五液。凡五氣所化之液，悉屬於腎；五液所化之氣，悉屬於肺；轉輸之臟，以制水生金者，悉屬於脾”（《醫宗必讀·水腫脹滿論》）。
水液生成以後，首先由脾通過升清作用，將其向上轉輸到心肺，同時壹部分未被吸收的水液，則與食物殘渣壹起下傳於大腸，從糞便中排出體外。
肺接受了脾上輸的大量水液，通過宣發肅降作用。將其敷布至周身。其中壹部分水液經肺的宣發作用，隨衛氣而運行於體表，外達四肢官竅，以濡養肌肉，潤澤皮膚，代謝以後的廢料和剩余水分，又通過陽氣的蒸騰，化生成汗液從汗孔排出。另壹部分水液經肺的肅降作用，以心臟為動力，隨營氣循經脈而運行於體內，以濡養五臟六腑，灌註於骨節和腦髓之中，在被機體組織器官利用之後，又集聚於腎。另外，在肺的呼氣運動中，也排出了少量的水氣。
腎為主水之臟，集聚於腎的水液在腎的氣化作用之下，被泌別成清者和濁者兩部分。其清者，通過腎中陽氣的蒸騰氣化作用，又復上歸於肺，由心肺再布散周身，以維持體內的正常水液量；其濁者，則通過腎中陽氣的溫化推動作用，不斷地化生成尿液，並且向下輸送至膀胱。當膀胱內尿液積到壹定量時，就產生尿意，從而及時自主地經尿道而排出體外。