概要
神奇寶貝動畫來源於神奇寶貝的遊戲，從1997年4月1日開始在東京電視臺播出。
電影版
（1）〈Pocket Monsters〉系列
主條目：超夢的逆襲
主條目：皮卡丘的歡樂假期
主條目：夢幻之神奇寶貝 洛奇亞爆誕
主條目：皮卡丘的探險隊
主條目：結晶塔之帝王
主條目：皮丘與皮卡丘
主條目：雪拉比 穿梭時空的相遇
主條目：皮卡丘的心跳捉迷藏
主條目：水都的守護神 拉帝亞斯與拉帝歐斯
主條目：皮卡皮卡的星空露營
主條目：七夜的許願星 基拉祈
主條目：神奇寶貝的跳舞秘密基地
主條目：裂空的訪問者 代歐奇希斯
主條目：夢幻與波導的勇者 路卡利歐
主條目：神奇寶貝保育家與蒼海的王子 瑪納霏
（2）〈Pocket Monsters Diamond&Pearl〉系列
主條目：決戰時空之塔 帝牙盧卡VS帕路奇犽VS達克萊伊
主條目：騎拉帝納與冰空的花束 雪米(暫譯)
除了壹般TV動畫版和電影版外，神奇寶貝動畫/節目，還分為以下幾種：
TV特別篇
6?1 特別篇1-第39集“皮卡丘的森林”（神奇寶貝復播特別動畫） 6?1 特別篇2-河馬王的壹天(敘述亞西亞島上河馬王壹天的生活) 6?1 特別篇3-超夢的逆襲-完整版(超夢的誕生/小智的旅程) 6?1 特別篇4-超夢重現 風雲再起！(TV長篇特別動畫、超夢的逆襲續集) 6?1 特別篇5-水晶版 雷公 雷的傳說(TV長篇特別動畫、水晶版特輯) 6?1 特別篇6-雪拉比 穿梭時空的相遇-特別篇(大木博士就是雪成的有利證據) 6?1 特別篇7-戰栗的幻影神奇寶貝（TV長篇特別動畫，由美國首播。神奇寶貝十周年紀念動畫） 6?1 特別篇8-神奇寶貝不可思議的迷宮 前勁隊出門去(暫)(TV特別動畫/十周年紀念動畫，由美國首播。電玩不可思議的迷宮救難隊特輯。在日本，是這幾篇裏面唯壹沒有在電視上放映的作品，而是在Yahoo KIDS上面提供在線播放) 6?1 特別篇9-神奇寶貝不可思議的迷宮 時間探險隊 黑暗探險隊(TV特別動畫/十周年紀念動畫，取自同名電玩而制作的特輯，在“神奇寶貝星期天”中播出。)短篇OVA
6?1 皮卡丘的歡樂聖誕99-以關都末期為故事背景，***收錄“遊戲聖誕”“玩雪去”兩則小故事。 6?1 皮卡丘的歡樂聖誕2000-以城都初期為故事背景，***收錄“滑冰去”“聖誕夜”兩則小故事。 6?1 皮卡丘的歡樂聖誕2001-以城都中期為故事背景，***收錄“信使鳥的禮物”“白色故事”兩則小故事。 6?1 我們是皮丘兄弟-分為“風船騷動篇”和“派對騷動篇”。“風船騷動篇”和“歡樂聖誕2001”壹同收錄在“皮卡丘歡樂大點名”，“派對騷動篇”則是日本後來另外推出的。 6?1 皮卡丘的夏日祭典-ANA機上限時放映，與電影版“裂空的訪問者”同年推出。 6?1 皮卡丘的鬼怪狂歡節-ANA機上限時放映，與電影版“夢幻與波導的勇者”同年推出。 6?1 皮卡丘的頑皮島(暫)-ANA機上限時放映，與電影版“神奇寶貝保育家與蒼海的王子”同年推出。 6?1 皮卡丘探險俱樂部(暫)-ANA機上限時放映，與電影版“決戰時空之塔（帝牙盧卡VS帕路奇犽VS達克萊伊）”同年推出。 6?1 皮卡丘冰之大冒險-ANA機上限時放映，與電影版“騎拉帝納與冰空的花束”同年推出。周刊神奇寶貝放送局
主條目：周刊神奇寶貝放送局
(Pokémon Hoso，歐美地區稱Pokémon Chronicles) 超世代播出時推出（2002/10/15~2004/9/28），內容以神奇寶貝的非主線動畫、綜藝節目，和回顧影集為主。
神奇寶貝星期天
(Pokémon Sunday)
6?1 繼周刊放送局後推出，內容以神奇寶貝的綜藝節目和回顧影集，及搜尋日常生活中各個令人好奇的問題為主。總集數
回顧以前影集的剪輯動畫
6?1 神奇寶貝秋天的特別篇(1997/10/7) 6?1 新年！神奇寶貝特別篇(1999/1/1) 6?1 小智與小遙！在芳緣的熱血戰鬥！！(2005/3/24 大型慶典前的特輯) 6?1 小智與小光！朝新的冒險邁進！！(2007/9/27 華麗大賽前的特輯)3D電影
6?1 2005-尋找夢幻！（日本Poké Park推出） 6?1 2006-皮卡丘的海底大冒險(日本電影院上映)天文影片
6?1 日本曾在2003年 為配合即將上映的超世代電影版“七夜的許願星”，由天文館推出神奇寶貝的天文影片“來自天空的挑戰”。