2015年11月4日《奇異博士》在尼泊爾開拍，片場照首度曝光，本尼迪克特·康伯巴奇蓄起了胡子和長發，以壹身當地服裝現身片場，而他的身後是具有當地特色的古式建築。從劇照來看，《奇異博士》劇組在拍攝史蒂芬前往東方治療雙手的戲份，這將會涉及到史蒂芬蛻變成為奇異博士起源的故事 。切瓦特·埃加福特扮演的莫都男爵也出現在隨後爆光的片場照裏 。
《奇異博士》在倫敦、紐約、香港、加德滿都等地拍攝 。
2015年12月8日，導演斯科特·德瑞克森和制片人凱文·費奇首次曝光壹張影片概念圖，同時還曝光了壹支幕後特輯 。
2015年12月17日，蜘蛛俠湯姆·赫蘭德出現在《奇異博士》片場 。
2016年4月3日《奇異博士》在紐約殺青。本尼在拍攝當天身穿戲服造訪了紐約曼哈頓的壹家漫畫書店與《奇異博士》漫畫書合影 。
2016年4月13日發布首款中文預告片及首款海報 。