1、肝腎的損害，尤其老年人的肝功能、腎功能較比年輕人就已經有不同程度的下降。部分藥物通過腎排泄，部分抗生素是通過肝代謝，所以幾乎所有的抗生素對肝和腎都或多或少有壹定的損害。
2、腸道菌群的紊亂，眾所周知抗生素濫用或者長期服用壹種抗生素，會導致腸道菌群的紊亂，造成腹瀉、不可抑制的水樣便等。這個時候需要立即停止抗生素的使用，重新建立腸道菌群。另外比較致命的副作用就是過敏的反應，壹旦出現會危及生命，這個時候需要及時地給予處理。
擴展資料：
註意事項：
1、敏體質慎用抗生素，對過敏的禁用。
2、肝功能不全慎用大環內酯類、磺胺類和抗結核、真菌藥。後兩者長期使用時，應定期復查肝功能。頭孢菌素類劑量較大時也可損壞肝功能。
3、老、幼用戶避免使用慶大黴素、鏈黴素、卡那黴素等腎毒性、耳毒性藥物。
4、磺胺類藥抑制甲狀腺功能，故甲狀腺功能低下者禁用。
5、中藥制劑雙黃連口服液、穿心蓮片、冬淩草片、金蓮花沖劑，草藥野菊花、金銀花、連翹、蒲公英、黃芩等，更適用於非化膿性上呼吸道感染，副作用較小。
6.無明確感染征象，應盡量避免使用抗生素，防止產生耐藥性(細菌對藥物的適應與抗藥)及雙重感染(敏感茵被殺滅後，不敏感菌因失去拮抗而感染機體)。
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