真菌性腸炎主要是由白色念珠菌引起的。白色念珠菌是腸道正常菌群之壹，長期使用廣譜抗生素或腎上腺皮質激素，真菌可大量繁殖引起腸炎。2歲以下嬰幼兒發病較多。起病可急可緩，大便次數增加，為黃色稀水便，泡沫多，有黏液，有發黴氣味，有的像豆腐渣樣，嚴重的可為膿便或膿血便，可有低熱、嘔吐、腹脹及腹痛。