1．急性腎炎 當過敏性紫癜性腎炎發生於皮疹已消退時需與急性腎炎鑒別，此時追詢病史，包括回顧皮疹形態、分布，關節和胃腸道癥狀有助於本病診斷。缺乏上述癥狀，早期有血清補體降低有助於急性腎炎的診斷。
2．狼瘡性腎炎 由於系統性紅斑狼瘡可有皮疹、關節痛和腎損害，須與本病相鑒別。過敏性紫癜性腎炎皮疹與紅斑狼瘡皮疹無論在形態和分布上均有顯著區別，診斷並不困難，兩者腎活檢有不同之處，如免疫熒光檢查，狼瘡性腎炎雖然也有IgA沈積，但常有大量其他免疫球蛋白沈積，且有C1q沈積，狼瘡性腎炎腎小球毛細血管壁的環樣變，也有助鑒別。
3．多動脈炎 此病在臨床上可類似本病，但血清IgA多不增高，皮膚及腎活檢也無IgA沈積，免疫熒光纖維蛋白均為陰性。此外，本病少見於5～15歲青少年。
4．IgA腎病雖然臨床上本病與 IgA腎病不同，但腎臟組織學檢查卻十分相似，大多有皮膚小血管lgA沈積，因此從組織學上兩者難以鑒別。近有報告僅有的區別是過敏性紫癜性腎炎腎組織常存在單核細胞和T淋巴細胞，但IgA腎病卻無此類細胞。此外，lgA腎病沒有皮膚損害，無對稱性、出血性皮疹。