男性患者好發於包皮系帶、冠狀溝、包皮、尿道、陰莖、肛門周圍和陰囊。病初為淡紅或汙紅色粟狀大小贅生物,性質柔軟,頂端稍尖,逐漸長大或增多。可發展成乳頭狀或囊狀,基底稍寬或有帶,表面有顆粒。在肛門部常增大,狀如菜花,表面濕潤或有出血,在顆粒間常積存有膿液,散發惡臭氣味,搔抓後可繼發感染。位於濕度較低幹燥部位的生殖器疣,損害常小而呈扁平疣狀。位於濕熱濕潤部位的疣常表現為絲狀或乳頭瘤狀,易融合成大的團塊。有嚴重肝病的患者濕疣可增大。妊娠可使濕疣復發或生長加快。臨床感染是指臨床上肉眼不能辨認的病變,但用3%-5%醋酸液局部外塗或濕敷5-10分鐘可在HPV感染區域發白,即所謂“醋酸白現象”。