2000年，組建國內第壹個多肽產品研究開發中心。
2001年，自主研發的生物活性多肽原料(中間體)被列為省級重大專項，同年，經國家食品藥品監督管理局批準組建深圳翰宇藥業股份有限公司。
2002年，多肽藥物生產基地被列為“深圳市高技術產業化示範工程”，經深圳市政府批準在深圳市高新區興建多肽藥物生產基地；同時被列為深圳市重大建設項目；多肽產品研究開發中心被列為深圳市工程技術研發中心；並承擔了國家“863”計劃項目和國家“十五”重大科技專項項目。
2003年，多肽藥物生產基地順利通過國家和省藥監部門的驗收，獲得《藥品生產許可》和《藥品GMP證書》；同時承擔了廣東省關鍵領域重點突破中標項目。
2004年，多肽藥物生產基地被列為“國家高技術產業化示範工程”；部分多肽藥物進入規模化生產和銷售。
2005年，公司承擔的國家“863”項目和國家“十五”重大科技專項順利通過科技部驗收；多肽研發中心被列為廣東省工程技術研究開發中心。
2006年，由公司承擔的國家高技術新型多肽藥物產業化示範工程項目，順利通過國家發改委驗收。
2007年，多肽藥物出口基地被列為“國家高技術產業化示範工程”；順利通過“全國產品質量和食品安全專項整治第三次現場會議”的檢查；承擔了國家“十壹五”重大科技專項項目；翰宇藥業入選為2007年度“中國最具成長性科技型企業100強”；獲得“深圳市科技創新獎”及“深圳市自主創新行業龍頭企業”稱號。
2008年，翰宇藥業與軟銀賽富亞洲投資基金、深圳市創新投資集團戰略合作，首期投入翰宇藥業資金1500萬美元；廣東省多肽藥物工程技術研究開中心順利通過驗收；公司入選為“2008德勤高科技、高成長中國50強”企業。
2009年10月28日，公司正式更名為“深圳翰宇藥業股份有限公司”，被認定為“國家級高新技術企業”；承擔和參與了3項“國家重大新藥創制”重大科技專項、2項國家高技術產業化項目；獲得了“廣東省科技術二等獎”。
2010年，被國家發改委授予“國家高技術新型多肽藥物產業化示範工程”稱號；被《福布斯》雜誌評選為“2010中國潛力企業200強”；入選“德勤亞太高成長500強”；順利完成股份制改造並且進入創業板上市審批階段。
2011年，經中國證監會核準，翰宇藥業首次公開發行股票並在創業板 上市，成為我國合成多肽第壹股；獲評“2011廣東省企業500強”； 研發中心被國家發改委認定為“國家地方聯合工程實驗室”。
2012年，入選“2012福布斯中國最具潛力企業榜”。
2013年，入選“2013福布斯中國最具潛力企業榜”。