周琦加盟的是休斯敦火箭隊，但並沒有得到太多的表現機會。周琦在火箭隊效力了兩個賽季，僅僅打了19場比賽，場均只能貢獻1.3分1.2個籃板。大部分時間，周琦都是在火箭隊的發展聯盟附屬球隊打球。
2018年12月份，火箭隊正式宣布裁掉周琦。在離開NBA之後，周琦決定重返CBA打球。經過壹番波折之後，周琦最終宣布重返新疆隊。2019年夏天，周琦還代表中國男籃出戰了男籃世界杯的賽事。中國隊在本屆世界杯發揮不佳，無緣晉級16強。
2019年國際籃聯籃球世界杯比賽成績
1、2019年8月31日晚，2019年籃球世界杯開戰第壹天，A組的中國男籃在五棵松體育中心迎戰小組賽第壹個對手科特迪瓦男籃。在上半場戰平的情況下，中國男籃最終以70比55戰勝科特迪瓦男籃，取得開門紅。
2、2019年9月2日，處在A組的中國男籃迎來小組最強勁對手——波蘭隊的挑戰。最終，經過四節鏖戰和壹個加時賽，中國男籃仍以76-79憾負波蘭，遭遇小組賽首場失利。
3、2019年9月4日，A組球隊進入到了最後壹個比賽日的比賽，中國男籃以59-72 的比分惜敗委內瑞拉男籃，小組的最終排名結果也被揭曉。最終，小組前兩名的波蘭男籃和委內瑞拉男籃進入到下壹階段的16強賽，而中國隊和科特迪瓦則無緣出線，只能參加下壹階段17-32名的排位賽。