1、主神獸不同：黑2抓的是是黑色酋雷姆，白2抓的是白色酋雷姆。
2、鑰匙系統不同：通關之後，黑2獲得“挑戰鑰匙”，白2獲得“助手鑰匙”。
3、劇情不同：黑白2是黑白劇情發生2年後的續作，有前代角色回歸劇情，其中有壹些彩蛋需要對黑白劇情有所了解才能理解，還有與黑白劇情有關的回憶模式可以開啟。