1、復合碘對各種細菌及其繁殖體、芽孢、病毒、真菌、原生動物、腸蟲、線蟲及體外寄生蟲均有顯著殺滅效果，而水產殺毒先鋒對寄生蟲沒有效果。
2、復合碘易溶於水，效果更快，而水產殺毒先鋒生效慢，所以復合碘效果好。