主任科員是我國公務員職位的壹種，屬於綜合管理類的非領導職位序列。主任科員是科長，屬於非領導職務，所以職責比科長、鄉長、鎮長略低。
崗位工資是有差別的，實際職位比主任科員略高。不同的省份對職位工資有不同的規定。壹般當年領導和非領導崗位的崗位工資在30-100元不等。
《新錄用公務員職務定級規定》第四條:新錄用公務員經考核合格的，按照下列規定定級:
(壹)從各類學校畢業生中直接錄用的無工作經歷的公務員:高中、中專畢業生，被任命為辦事員的，定為27級；大學畢業生，任命為辦事員，定為26級。
本科畢業生、取得雙學士學位的本科畢業生(含學制六年以上的本科畢業生)、研究生班畢業的研究生和未取得碩士學位的研究生，任命為辦事員，定為二十五級；獲得碩士學位的研究生任副主任，定為24級；任命獲得博士學位的研究生為主任科員，定為22級。
(2)其他新錄用公務員:具有公務員身份的，可參照其原職務和等級，與本機關同等條件人員進行比較，確定其職務和等級。其他有工作經歷的人員，可以根據其任職資格和工齡，參照本機關同等條件人員確定職務和級別。新錄用公務員的服務時間從試用期滿之日起計算。
第五條新錄用公務員的職務定級按照下列程序進行:
(1)本人總結試用期德、能、勤、績、廉情況。
(二)有權對擬任職定級人員進行綜合考核，提出擬任職位和擬級別的意見。
(三)任免機關審批、下達新錄用公務員的定級決定。
新錄用公務員定級後，按照有關規定進行公務員登記。
第六條新錄用公務員在機關的最低服務年限為五年(含試用期)。
第七條違反本規定，有下列情形之壹的，由縣級以上領導機關或者公務員主管部門按照管理權限，區別不同情況，分別責令改正或者宣布無效；對負有責任的* * *和直接責任人員視情節輕重予以處理:
(壹)突破機構規格、超職數給新錄用公務員定級的；
(二)按規定的條件和程序錄用新的公務員；
(三)試用期計入服務年限；
(四)違反法律法規的其他情形。
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